ライフサイエンス分野の ポータルサイト連携のための調査 報告書
目 次 はじめに... 1 1. Jabion... 2 1.1. 概要...2 1.2. 全体の構成...4 1.3. 用語辞書...5 1.4. コラム一覧...9 1.5. 遺伝子百科...14 1.6. 文献検索...20 1.7. ご意見箱...22 1.8. 道具箱...24 1.9. お役立ちリンク...36 1.10. Jabion ガイド...72 1.11. 学習に役立つ...75 1.12. 研究に役立つ...79 1.13. ウェブを活用する...81 1.14. ご意見箱...86 1.15. おすすめリンク...87 1.16. 新着コラム...88 1.17. 注目ニュース...89 1.18. バイオポータルプロジェクトとは...90 1.19. サイトポリシー...90 1.20. 更新情報 /RSS...91 1.21. お問い合わせ...92 1.22. 利用者層を中心とした内容の分析...93 2. ライフサイエンスの広場... 96 2.1. 概要...96 2.2. 全体の構成...98 2.3. 政策 予算...100 2.4. 研究事業... 107 2.5. 生命倫理 安全に対する取組... 113 2.6. 審議会... 118 2.7. 研究支援... 124 2.8. イベントカレンダー... 130
2.9. ライフサイエンス研究日本の拠点と世界の状況... 132 2.10. キッズコーナー... 135 2.11. 科学技術 学術審議会ライフサイエンス委員会... 139 2.12. 科学技術 学術審議会生命倫理 安全部会... 140 2.13. 報道発表...141 2.14. 公募 審議会情報... 143 2.15. 研究者向け情報... 145 2.16. 用語解説...146 2.17. リンク集...146 2.18. サイトポリシー... 146 2.19. English... 146 2.20. 利用者層を中心とした内容の分析... 147 3. UMIN... 150 3.1. 概要... 150 3.2. 全体の構成...152 3.3. 検索... 154 3.4. ELBIS オンライン論文査読システム... 162 3.5. 重要 :UMIN 電子メールに関するお知らせとお願い... 167 3.6. 重要 :WWW サーバの 128 ビット暗号化... 169 3.7. お知らせ... 170 3.8. 一般用サービス... 173 3.9. サイトマップ...199 3.10. 大学病院業務サービス... 202 3.11. 会員制ホームページ... 208 3.12. お問い合わせ... 209 3.13. 電子メール...212 3.14. UMIN ID の取得等パスワード更新等... 213 3.15. UMIN のご紹介... 215 3.16. サービス一覧等... 218 3.17. ELBIS 医療 生物学系電子図書館... 222 3.18. INDICE インターネット医学研究データセンター... 224 3.19. UMIN AC 学会情報... 224 3.20. HVPN.net 医療 VPN... 224 3.21. DIOL 医薬品 医療材料情報... 224 3.22. OASIS ISLET 会員制ホームページ... 225 3.23. MEDU 教育 研修... 225
3.24. AudioVisual 映像メディア... 225 3.25. 医療 生物学系の情報 (UMIN 提供情報 + リンク )... 228 3.26. 研究 教育 診療活動に必要な情報 ( リンク )... 235 3.27. 新着情報...237 3.28. 大学病院等新情報 (NUHS)[ 掲載ご希望の方へ ]... 241 3.29. 問い合わせフォーム... 242 3.30. 新着情報欄に掲載ご希望の場合... 242 3.31. ENGLISH...243 4. 今後有用と考えられる連携の仕組み... 245 4.1. 連携の枠組み...245 4.2. 連携のイメージ図... 249 まとめ... 251
ライフサイエンス研究のこれからを知りたい4. 今後有用と考えられる連携の仕組み 本報告書 1.Jabion 及び 2. ライフサイエンスの広場 の調査結果を踏まえ ライフサイエンス分野のポータルサイト連携のための仕組みを以下に提示した 4.1. 連携の枠組み Jabion ライフサイエンスの広場 の調査結果を踏まえ ライフサイエンス分野のポータルサイト連携に必要と思われる枠組みを利用目的別に以下の通り整理した (1) ライフサイエンス研究のこれからを知りたい (2) ライフサイエンス研究の状況を知りたい (3) ライフサイエンスについて学びたい以下に 各枠組みの内容及び想定利用者層について整理した結果を示した 4.1.1. ライフサイエンス研究のこれからを知りたい本枠組みの内容として 日本におけるライフサイエンス分野のこれから すなわち 研究推進方策や予算 規制動向等を想定した また 利用者として 当該分野の研究者 ( 生物学 生命科学を研究対象としている研究者 ) を想定した 予算を知りたい 政策を知りたい a. 国の予算を知りたい b. 予算を取りたい c. 推進方策を知りたい d. 規制の動向を知りたい 図 4.1.1 ライフサイエンス研究のこれからを知りたい の枠組み 245
また 図 4.1.1 中の a.~d. の内容としては 以下に挙げるようなコンテンツが想定される 表 4.1.1 枠組みに含まれる具体的コンテンツ案 枠組み 具体的なコンテンツの例 備考 a. 国の予算を知りたい ライフサイエンス関連予算 国家プロジェクト関連予算 競争的資金等 ライフサイエンスの広場 に一部あり 文部科学省の予算については知ることができる b. 予算を取りたい 公募情報 ライフサイエンスの広場 に文部科学省分のみあり 分野別の整理は行われていない c. 推進方策を知りたい 科学技術基本計画 ハ イオテクノロシ ー戦略大綱 ライフサイエンス関連の審議会等情報等 ライフサイエンスの広場 に一部あり 審議会等情報は 文部科学省分については知ることができる d. 規制の動向を知りたい 生命倫理 安全に関する情報 臨床研究に関する手続きや法令等情報 疫学研究に関する手続きや法令等情報 その他 新規法令等にかかる検討状況の情報等 ライフサイエンスの広場 に一部あり 規制等情報は 文部科学省がかかわるものについては知ることができる 4.1.2. ライフサイエンス研究の状況を知りたい本枠組みの内容として ライフサイエンス分野の研究の状況 すなわち 研究成果や研究に用いることができるツール サイト等を想定した また 利用者として 当該分野の研究者 ( 生物学 生命科学を研究対象としている研究者 ) 当該分野の学生 ( 生物学 生命科学を研究対象としている学生 ) を想定した 246
ライフサイエンス研究の状況を知りたい 文献 ( 論文 書籍 ) のコラム等 る a. 国全体での研究を知りたい b. 研究機関毎の取組を知りたい c. 専門的に知りたい研究成果を知りたい d. トピックスを知りたい e. 最新のデータベースや研究用リソースを 活用したい 図 4.1.2 ライフサイエンス研究の状況を知りたい の枠組み また 図 4.1.2 中の a.~e. の内容として以下に挙げるようなコンテンツが想定される 表 4.1.2 枠組みに含まれる具体的コンテンツ案 枠組み 具体的なコンテンツの例 備考 a. 国全体での研究を知りたい ライフサイエンスに関する世界の状況との比較 国で実施している研究プロジェクトの内容や成果 ライフサイエンスの広場 に一部あり 文部科学省分については知ることができる b. 研究機関ごとの取組を知りたい 個別機関ごとの研究内容や成果 研究者情報 研究者情報 は Jabion ライフサイエンスの広場 とも掲載されていない c. 研究成果を専門的に知りたい 文献 ( 論文 書籍 ) 情報 学会発表内容 研究プロジェクトの内容や成果 特許情報 学会発表内容 は Jabion ライフサイエンスの広場 とも掲載されていない 等 d. 研究成果のトピックスを知りたい 新聞記事検索 各研究機関が発表するプレスリリース Jabion ライフサイエンスの広場 で閲覧又は検索することができ シンポジウム等のイヘ ント情報等 247
枠組み具体的なコンテンツの例備考 e. 最新のデータベースや研究用リソースを活用したい ゲノム等解析ツール 生物情報等データベース Jabion に一部掲載されている 4.1.3. ライフサイエンスについて学びたい本枠組みの内容として 生物学 生命科学分野に関する学習を想定した また 利用者として 当該分野の学生 ( 生物学 生命科学を研究対象としている学生 ) 他分野の研究者 ( 生物学や生命科学の分野と共同研究を考えている研究者 ) 教師 ( 生物学の高校教師等 ) 一般 ( 一般市民等 ) を想定した イフサイエンスについて学びたい等 a. 専門用語の意味を知りたい b. 専門的に学びたい特定のテーマを学びたい c. 楽しく学びたい d. 専門的に学びたい d. 研究成果を知りたい部リンクされている ラe. 専門的に学びたい 図 4.1.3 ライフサイエンスについて学びたい の枠組み また 図 4.1.3 中の a.~e. の内容として以下に挙げるようなコンテンツが想定される 表 4.1.3 枠組みに含まれるコンテンツ案 枠組み 具体的なコンテンツの例 備考 a. 専門用語の意味を知りたい 用語解説 オントロジーを利用した用語検索 Jabion に一部掲載されている 等 b. 特定テーマを専門的に学びたい Web ラーニング Jabion にリンクされている c. 特定テーマを楽しく学びたい 一般市民向け生物学 生命科学解説ページ Jabion ライフサイエンスの広場 に一 248
枠組み具体的なコンテンツの例備考 d. 研究成果について専門的に学びたい e. 研究成果についてトピック的に学びたい 文献 ( 論文 書籍 ) 情報 学会発表内容 研究プロジェクトの内容や成果 特許情報等 新聞記事検索 各研究機関が発表するプレスリリース 文献 ( 論文 書籍 ) のコラム等 シンポジウム等のイベント情報等 表 4.1.2 の c と共通 表 4.1.2 の d と共通 4.2. 連携のイメージ図本調査においては Jabion 及び ライフサイエンスの広場 を中心に調査 分析を行い これを基にライフサイエンスポータルサイトの連携の枠組みを考案した ポータルサイト連携に含めるべき詳細コンテンツについては 現存する様々なライフサイエンスポータルサイトの調査をさらに進める必要があると考えられるが これらライフサイエンス分野のポータルサイトは Jabion に代表されるような 研究支援情報に強みを持つサイト ( 研究に利用できるツール等が充実しているサイト ) もしくはライフサイエンスの広場に代表されるような 政策 予算情報に強みを持つサイト ( 研究プロジェクトの内容や成果情報も含む ) の 2 つに大別できる可能性がある ( 図 4.2.1) ライフサイエンス分野の様々なポータルサイト 研究支援情報に強みを持つサイト例 :Jabion 政策 予算情報に強みを持つサイト例 : ライフサイエンスの広場 図 4.2.1 ライフサイエンス分野のポータルサイトの分類 この 2 種類のサイトの連携方針の1つとして 用語解説の活用が挙げられる 現在のところ 本調査で対象とした Jabion において遺伝子百科のページで単語にカーソルを合わせると 単語の意味を記述したボックスが表示され ライフサイエンス辞書との連携が図られている 249
用語解説は Jabion のような当該分野の研究者 学生を対象とした高度な内容を取り扱うページ ( 研究支援( ツール等 ) 情報に強みを持つサイト ) での活用と同時に 他分野の研究者や教師 一般市民など ライフサイエンス研究の内容や成果に興味を持つ利用者が閲覧するページ ( 政策 予算情報に強みを持つサイト ) での活用も考えられる 本報告書では 研究支援情報に強みを持つサイト と 政策 予算情報に強みを持つサイト との連携の1 例として 研究成果と用語解説とを連携させた場合のサンプル画面を示す 神経細胞 英 neuron 動物の神経組織を形成する細胞 神経細胞 図 4.2.2 連携の 1 例としてのサンプル画面 250
まとめ 本調査においては Jabion 日本語バイオポータルサイト及び ライフサイエンスの広場 文部科学省ライフサイエンスポータルサイトについて その掲載内容の詳細調査及び利用者層を中心とした内容の分析を行った また UMIN 大学病院医療情報ネットワークについては 掲載内容の詳細調査を実施した さらに これらの調査及び分析を踏まえ ライフサイエンス分野のポータルサイト連携に必要と思われる枠組みとして (1) ライフサイエンス研究のこれからを知りたい (2) ライフサイエンス研究の状況を知りたい (3) ライフサイエンスについて学びたい の 3 分類を提示した また 用語解説 を材料に 研究支援情報 ( ツール等 ) に強みを持つサイト と 政策 予算情報に強みを持つサイト の連携方法の一例を示した 251