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- みずき かたづ
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1 写 食安監発 1217 第 1 号平成 24 年 12 月 17 日 都道府県各保健所設置市特別区 衛生主管部 ( 局 ) 長殿 厚生労働省医薬食品局食品安全部監視安全課長 腸管出血性大腸菌 O26 O111 及び O157 の検査法について 標記については 平成 24 年 5 月 15 日付け食安監発 0515 第 1 号により通知しているところです 今般 VT 遺伝子検出法によるスクリーニング法等について所要の改正を行い 当該通知を廃止し 別添のとおりとするので 検査を行う場合はこの方法により実施されるようお願いします
2 ( 別添 ) 食品からの腸管出血性大腸菌 O26 O111 及び O157 の検査法 食品からの腸管出血性大腸菌 O26 O111 及び O157 の試験は 原則として ベロ毒素 (VT) 遺伝子検出法によるスクリーニングを行い 陽性であった場合には分離培養法で菌の分離を行い 確認試験の結果 判定する 1. 検体の採取食品検体 200g 以上を採取する なお 表面汚染が考えられる食品は 表面部を厚さ cm に削り これを検体とする 1 2. 試料の調製採取した検体の全体を細切 混和後 その 25gをストマッカー袋に秤量して これを試料とする 3. 増菌培養以下の増菌培養液を VT 遺伝子検出法及び培養法に供試する なお 10 ml を試験が終了するまで冷蔵保存する ストマッカー袋中の試料に 225 ml の増菌培地 ( 室温 ) を加え1 分間以内のストマッカー処理などを行った後 42±1 で 22±2 時間培養する 4. 増菌用培地 1)mEC 培地 ( 日水製薬 オキソイド製造 ; 関東化学販売 極東製薬工業 栄研化学 メルク等 ) 組成 : ペプトン 20.0 g 胆汁酸塩 1.12 g ラクトース K 2 HPO g KH 2 PO g 6.9±0.1 備考 : 121 で 15 分間滅菌後冷却し そのまま使用する 2)mEC 培地 (USDA 法 )( 自家調製 ) 組成 トリプトン 20.0 g 胆汁酸塩 (Bile salts No.3) 1.12 g ラクトース 1 水を検体とする場合には 食品衛生検査指針微生物編 2004 の検体の採取 試料の調製 増菌培養 ( 増菌培地は本検査法の培地を使用する ) を参考に実施する 1
3 K 2 HPO g KH 2 PO g 6.9±0.1 備考 : 121 で 15 分間滅菌後冷却し そのまま使用する 凍結等によって菌の損傷が考えられる場合は 各試験検査機関において本検査法に示す増菌培養法と同等であると判断した上で mec 培地において 36±1 培養など選択性を弱めた増菌培養法の使用を推奨する その他の培地についても各試験検査機関で同等性について評価を行い使用しても良い また 検体中の腸管出血性大腸菌以外の菌の増殖が腸管出血性大腸菌の増殖を妨げると考えられる場合は ノボビオシン加 mec 培地において 42±1 培養など選択性を高めた増菌培養法も考慮する 5.DNA 抽出法増菌培養液から DNA 抽出を行ない それを試料として6の VT 遺伝子の検出試験を行う DNA 抽出法としては以下のものが利用できる キットについては各添付文書を参照すること 抽出 DNA は氷上で取り扱い 保存は凍結が望ましい なお 増菌培養液の加熱による単純な DNA 抽出法は検出感度が優れないため使用しない 可能であれば1 検体につき2 本のマイクロチューブを用いて DNA を抽出する なお 脂肪の多い食品については 食品成分が遺伝子増幅に影響を及ぼすため 1) のアルカリ熱抽出法を使用する 1) アルカリ熱抽出法培養液 0.1 ml をマイクロチューブにとり 10,000Xg 10 分間遠心し 上清を取り除いた沈渣に滅菌した 50 mm NaOH 85 l を添加して 100 で 10 分間加熱処理する その処理液に滅菌した1M Tris-HCl( 7.0)15 l を加えて中和し 遠心上清 (2,000~10,000Xg 10 分間 ) を検体とする また VT 遺伝子検出キットに含まれる DNA アルカリ抽出試薬を使用できる ( ただし 上記と同等のアルカリ液及び中和液の組成及び容量に限る ) 抽出後は氷上で静置し直ちに (60 分以内 ) 検出試験に使用する 直ちに使用しない場合には0~4 で保存し 4 時間以内に使用する 2)PrepMan Ultra Sample Preparation Regent( アプライド バイオシステムズジャパン ) 3)DNeasy Tissue Kit( キアゲン ) 4)High Pure PCR Template Preparation Kit( ロシュ ダイアグノスティックス ) 5) その他 同等品も使用できる 6.VT 遺伝子検出法抽出した DNA を用いて VT 遺伝子の検出試験を実施する VT 遺伝子検出法としては以下のものが利用できる 試験には陽性コントロールを設定する VT 遺伝子検出試験の結果 陰性であった場合は試験を終了する 陽性であった場合は 当日中に7 以降の分離培養を行う 2
4 1)PCR 法市販の VT 遺伝子検出キット又は公表されているプライマーを各試験検査機関で合成 調製し市販の遺伝子増幅酵素にて反応を行う これについては以下のものが利用できる また PCR 産物の電気泳動においては 1,000 bp 以下の核酸分離に対応した低分子用アガロースゲルを使用する (1) 市販のキットを使用する場合 1 O-157( ベロ毒素遺伝子 )PCR Screening Set( タカラバイオ ) 94 で1 分 55 で 1 分 72 で 1 分を 35 サイクル 72 で 10 分を1サイクル行う 増幅 DNA の大きさは 171 bp である 2 その他 同等の機能を有する試薬 機器が使用できる (2) 公表されているプライマーを各試験検査機関で合成 調製し 市販の遺伝子増幅酵素を使用する場合 1 Lin et al. Microbiol. Immunol. 37: , ( 使用方法例 ) ア. 表 1に示した反応液を調製する 表 1 反応液の調製試薬容量 Template 5.0 l 滅菌 l 10 X Ex Taq Buffer 5.0 l dntp mixture ( 各 2.5 mm) 4.0 l Takara Ex Taq (5U/ l) 0.25 l 5pmol/ l プライマー Sense: 0.5 l Antisense: 0.5 l 計 50.0 l Sense: 5 -GAA CGA AAT AAT TTA TAT GT-3 Antisense: 5 -TTT GAT TGT TAC AGT CAT-3 イ.94 で1 分 43 で 1.5 分 72 で 1.5 分を 40 サイクル行う 増幅 DNA の大きさは 905 bp である 2その他 反応条件を検討し同等であると判断されたプライマー及び PCR 酵素が使用できる 2)Loop-mediated isothermal amplification(lamp) 法以下のものが利用できる (1)Loopamp 腸管出血性大腸菌検出試薬キット ( 栄研化学 ) 対応機種 :Loopamp リアルタイム濁度測定装置 (LA-320C 及び RT-160C: 栄研化学販売 ) (2) その他 同等の機能を有する機器が使用できる 付属の DNA 抽出試薬の他に 5. に示した DNA 抽出方法による DNA 抽出液も使用できる 3)Real-time PCR 法市販の VT 遺伝子検出キット又は公表されているプライマー及びプローブを各試験検査機 3
5 関で合成 調製し 市販の Master Mix にて反応を行う これについて下記のものが利用できる (1) 市販キットを使用する場合 1 CycleavePCR O-157(VT gene) Screening Kit Ver. 2.0( タカラバイオ ) 対応機種 : Thermal Cycler Dice Real Time System Ⅱ( タカラバイオ ) ABI PRISM Fast 7700 及び 7900( ライフテクノロジーズジャパン ) LightCycler 480II 及び Nano( ロシュ ダイアグノスティックス ) ただし ABI PRISM Fast 7700 及び 7900 では Manual 解析で baseline を安定した部分に修正し Threshold を適切な値に修正する また LightCycler 480II において Abs Quant/2nd Derivative Max(Auto 解析 ) で適切な判定が行えない場合は Abs Quant/Fit Points 解析で Background を安定した部分 ( 目安として 4-10 cycle) に手動設定し解析を行う 2その他 同等の機能を有する試薬 機器が使用できる (2) 公表されているプライマー及びプローブを合成 調製し 市販の Master Mix を使用する場合 1 Nielsen et al. J. Clin. Microbiol. 41: , ( 使用方法例 ) ア. 機器 ABI PRISM Fast 7700 及び 7900 LightCycler 480II 及び Nano Thermal Cycler Dice Real Time System Ⅱが使用できる ただし ABI PRISM 7500Fast では standard mode にて使用する イ. 試薬 TaqMan Environmental Mater Mix 2.0 ( ライフテクノロジーズジャパン Product No ) TaqMan プローブ プライマー 滅菌ウ. 反応液の準備表 2に示した反応液を調製する 総反応容量は 30.0 l 又は 50.0 l とする エ. 反応プレートのウェル又は反応チューブに 25.0 l 又は 45.0 l ずつ反応液を入れる オ. 検体 DNA 5 l を加えて 試験を行う カ. 増幅反応は 50 で2 分 95 で 10 分を1サイクル 次いで 95 で 15 秒 60 で 1 分を 40 サイクルに設定し ランを開始する キ. ランが終了したら データ解析をする ク.ABI PRISM Fast 7700 及び 7900 では Auto 解析又は Threshold を 0.2 に設定して解析する Baseline については 安定した部分 ( 目安として 3-10 cycle) に手動設定による解析を行う 各検体につき Ct 値が得られている場合を陽性とする また LightCycler 480II において Abs Quant/2nd Derivative Max (Auto 解析 ) で適切な判定が行えない場合は Abs Quant/Fit Points 解析で Background を安定した部分 ( 目安として 4-10 cycle) に手動設定し解析を行う LightCycler Nano では Auto 解析を行う Thermal Cycler Dice Real Time System 4
6 Ⅱでは CP 法 (Auto 解析 ) にて解析する 表 2-1 反応液の調製 1 試薬 容量 滅菌 4.0 l TaqMan Environmental Mater Mix l 10 pmol/ l プライマー VT1-F 3.0 l VT1-R 3.0 l VT2-F 3.0 l VT2-R 3.0 l 5pmol/ l プローブ VT1-P 2.0 l VT2-P 2.0 l 計 45.0 l 表 2-2 反応液の調製 2 試薬 容量 滅菌 4.0 l TaqMan Environmental Mater Mix l 20 pmol/ l プライマー VT1-F 0.9 l VT1-R 0.9 l VT2-F 0.9 l VT2-R 0.9 l 5pmol/ l プローブ VT1-P 1.2 l VT2-P 1.2 l 計 25.0 l VT1-F: 5 -GGA TAA TTT GTT TGC AGT TGA TGT C-3 VT1-R: 5 -CAA ATC CTG TCA CAT ATA AAT TAT TTC GT-3 VT1-P: 5 -FAM-CCG TAG ATT ATT AAA CCG CCC TTC CTC TGG A-TAMRA-3 VT2-F: 5 -GGG CAG TTA TTT TGC TGT GGA-3 VT2-R: 5 -GAA AGT ATT TGT TGC CGT ATT AAC GA-3 VT2-P: 5 -FAM-ATG TCT ATC AGG CGC GTT TTG ACC ATC TT-TAMRA-3 2 Bellin et al. J. Clin. Microbiol. 39: , ( 使用方法例 ) ア. 機器 LightCycler Ver. 2.0(LightCycler Capillaries 100 l 用 ) が使用できる イ. 試薬 LightCycler FastStart DNA Master HybProbe プローブ プライマー 滅菌精製 水 ウ. 反応液 表 3に示した反応液を調製する エ. 反応液 45.0 l と検体 DNA 5 l をキャピラリーにアプライする 5
7 オ. 増幅反応は 95 で 10 分を 1 サイクル 次いで 95 で 10 秒 60 で5 秒 (55 まで 0.5 ずつタッチダウン ) 72 で 20 秒を 45 サイクル 40 で 30 秒を 1 サイクル行う カ. ランを開始する キ. ランが終了したら データ解析をする 表 3 反応液の調製試薬容量滅菌 14.0 l 10 LC-DNA Master 5.0 l 25mM MgCl l 10 pmol/ l プライマー VT1 StxA l StxA l VT2 StxA l StxA l 3pmol/ l プローブ VT1 StxA1 FL l StxA1 LC l VT2 StxA2 FL l StxA2 LC l 計 45.0 l StxA1 598: 5 -AGT CGT ACG GGG ATG CAG ATA AAT-3 StxA1 1015: 5 -CCG GAC ACA TAG AAG GAA ACT CAT-3 StxA1 FL724: 5 -CTG TCA CAG TAA CAA ACC GTA ACA TCG CTC-FITC-3 StxA1 LC693: 5 -Red705-TGC CAC AGA CTG CGT CAG TGA GGT-3 StxA2 679: 5 -TTC CGG AAT GCA AAT CAG TC-3 StxA2 942: 5 -CGA TAC TCC GGA AGC ACA TTG-3 StxA2 FL769: 5 -MAG AGC AGT TCT GCG TTT TGT CAC TGT CA-FITC-3 StxA2 LC799: 5 -Red640-AGC AGA AGC CTT ACG CTT CAG GC-3 3その他 同等の機能を有する試薬 機器が使用できる 4) その他 同等の手法も使用できるが 感度が1X10 4 cfu/ml( 増菌培養液 ) より優れるものを使用することとし 感度の確認が必要な場合には各試験検査機関にて次の方法を参照して行う 血清群 O26 O111 又は O157(VT 陽性株 ) の菌濃度が約 1X10 4 cfu/ml( 検体の増菌培養液 ) を作製し試験する 血清群 O26 O111 又は O157(VT 陽性株 ) を Tryptic soy broth ( 栄研化学 日水製薬 オキソイド製造 ; 関東化学販売 日本ベクトン ディッキンソン等 )(10 ml) に接種し 36±1 で 18±1 時間培養する ( 約 5X10 8 cfu/ml) この培養液を対象検体の mec 培養液 9ml を用いて 10-4 倍希釈する この 10-4 倍希釈液 1ml を さらに4ml の対象検体の mec 培養液で希釈した菌液を試料とする この希釈菌液は約 1 X10 4 cfu/ml( 検体の増菌培養液 ) とし試験に用いる 菌液調製について 各機関であらかじめ菌株の増殖程度を確認し 必要ならば希釈倍率の変更を行う 6
8 7. 分離培養法 VT 遺伝子検出試験の結果 陽性であった場合は 当日中に分離培養を行う 分離培養は増菌培養液の直接塗抹及び免疫磁気ビーズ濃縮液の塗抹によって行う 直接塗抹法については増菌培養液 10 l 免疫磁気ビーズ法については免疫磁気ビーズ濃縮液 10~20 l を各種分離平板培地 1 枚あたりに画線塗抹し 36±1 で 18~24 時間培養後 疑われるコロニーを分離する 多くの単離コロニーが出現するように 1 種類につき2 枚以上の分離平板培地を用いる 二分画培地の場合は相当の面積に塗抹する また 増菌培養液を希釈したものを塗抹するなどの操作を必要に応じて行う 1 検体につき典型的コロニーをできる限り 5 個以上釣菌する なお 凍結等によって菌の損傷が考えられる場合は セフィキシム 亜テルル酸カリウム (CT) に感受性が高いことが考えられるので CT 非添加の分離平板培地も使用する 1) 直接塗抹法セフィキシム 亜テルル酸カリウム添加ソルビトールマッコンキー (CT-SMAC) 寒天培地及び 2) の (2) に示す血清群 O111 用の酵素基質培地のうち1 種類について 各 1 枚ずつ計 2 枚を使用する CT-SMAC 寒天培地では 血清群 O157 はソルビトール非分解又は遅分解の無色透明コロニー 血清群 O26 及び O111 はソルビトール分解の赤色コロニーを形成する それぞれの典型的コロニーを釣菌して血清凝集にて確定を行う 酵素基質培地では それぞれの培地での典型的な血清群 O111 のコロニー また 大腸菌のコロニーを各培地上での特徴に従って釣菌し 8 以降の血清型別試験を行う CT-SMAC 寒天培地 ( 市販生培地 自家調製又は基礎培地使用 : オキソイド製造 ; 関東化学販売 日水製薬 メルク 栄研化学 日本ベクトン ディッキンソン等 ) 基礎培地組成 : ペプトン 20.0 g 胆汁酸塩 1.5 g ソルビトール ニュートラルレッド 0.03 g クリスタルバイオレット g 寒天 1 7.2±0.1 備考 :121 で 15 分間滅菌後 50 以下に冷却し 以下に示す添加剤を無菌的に加えたのち 滅菌シャーレに分注し寒天平板として使用する 典型的な血清群 O157 はソルビトール非分解又は遅分解コロニーであり無色透明コロニーを形成する 添加剤 : 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる 2) 免疫磁気ビーズ法 (1) 免疫磁気ビーズとしては以下のものが利用できる 各社ビーズの仕様に合わせた各ビーズ液量を別々の 1.5 ml チューブに入れ 各々に1ml ずつ培養液を加え濃縮する この際 7
9 異なる血清群のビーズを混合して用いてはならない また 濃縮操作は各社製ビーズの仕様に合わせ 0.05% Tween20 加 PBS 又は滅菌生理食塩水を使用し最終的に 0.1 ml に懸濁する 詳細な試験方法は 各仕様書を参照する 交差汚染を避けるためにマイクロチューブの蓋をあける際は 固く絞ったアルコール綿で蓋を覆うなどの配慮が必要である また ビーズ吸着操作後の培養液や洗浄液を取り除く際には ディスポーサブルのスポイトの使用やマイクロピペットの汚染防止などを配慮する 1 血清群 O26 ア. 免疫磁気ビーズ O26 生研 ( デンカ生研 ) イ.Dynabeads EPEC/VTEC O26( ダイナル製造 ; ベリタス販売 ) 2 血清群 O111 ア. 免疫磁気ビーズ O111 生研 ( デンカ生研 ) イ.Dynabeads EPEC/VTEC O111( ダイナル製造 ; ベリタス販売 ) 3 血清群 O157 ア. 免疫磁気ビーズ O157 生研 ( デンカ生研 ) イ.Dynabeads anti-e.coli O157( ダイナル製造 ; ベリタス販売 ) 4 各血清群につき その他 同等品も使用できる (2) 免疫磁気ビーズ塗抹法 1 血清群 O26 セフィキシム 亜テルル酸カリウム添加ラムノースマッコンキー (CT-RMAC) 寒天培地を必ず使用する また CT-Vi RX O26 寒天培地 CT-クロモアガー O26/0157 培地 CT-SMAC 寒天培地 CT-ColiID 寒天培地等の血清群 O26 が鑑別できる培地を1 種類以上併用する セフィキシム及び亜テルル酸カリウム等の添加によって選択性の高まることが期待できるため 分離平板培地にはこれらを添加する ア.CT-RMAC 寒天培地 ( 自家調製 MacConkey Agar Base( 日本ベクトン ディッキンソン等 ) の使用又は市販生培地 : デンカ生研 日水製薬 ) 基礎培地組成 : ペプトン 20.0 g 胆汁酸塩 (Bile salts No.3) 1.5 g ラムノース ニュートラルレッド 0.03 g クリスタルバイオレット g 寒天 1 7.2±0.1 備考 :121 で 15 分間滅菌後 50 以下に冷却し 以下に示す添加剤を無菌的に加えたのち 滅菌シャーレに分注し寒天平板として使用する 典型的な血清群 O26 はラムノース非分解又は遅分解コロニーであり無色透明コロニーを形成する ラムノース分解性の他の大腸菌は赤色コロニーを形成する 添加剤 : 培地 1,000ml に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg 8
10 を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる イ.CT-Vi RX O26 寒天培地 ( 栄研化学 ) 基礎培地組成 : ペプトン 1 胆汁酸塩 1.5 g L-ラムノース フェノールレッド 0.03 g 発色基質 0.3 g 寒天 1 7.0±0.2 備考 :121 で 15 分間滅菌後 50~60 に冷却し 以下に示す添加剤を無菌的に加えたのち 滅菌シャーレに分注し寒天平板として使用する 典型的な血清群 O26 は青紫 ~ 黒色コロニーを形成する 血清群 O26 以外の大腸菌は黄緑 ~ 青緑色を また 大腸菌以外の腸内細菌は緑 黄色又は赤色のコロニーを形成する ブドウ球菌などの腸内細菌以外の菌はほとんど発育しない 添加剤 : 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる ウ.CT-クロモアガー O26/0157 培地 ( クロモアガー製造 ; 関東化学販売 ) 基礎培地組成 : ペプトン及び酵母エキス 8.0 g 選択剤 発色基質混合物 23.0 g 寒天 1 7.0±0.2 備考 : 加熱溶解後 ( オートクレーブ不可 過度の加熱も避けること )50 以下に冷却し 以下に示す添加剤を無菌的に加えたのち 滅菌シャーレに分注し寒天平板として使用する 作製した寒天平板は冷蔵保存するが その保存期間は 2~8 で 30 日以内とする 典型的な血清群 O26 は緑色コロニーを 血清群 O157 は赤色コロニーを形成する その他の大腸菌は赤紫 ~ 紫色のコロニーを形成する 添加剤 : 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる エ.CT-chromID Coli 寒天培地 ( ボトル培地 ; シスメックス ビオメリュー ) 基礎培地組成 : ゼラチンペプトン 7.0 g 酵母エキス 3.0 g 胆汁酸塩 1.5 g 活性化剤混合物 0.3 g 発色基質混合物 0.3 g 9
11 寒天 備考 : 加温溶解後 50 以下に冷却し添加剤を無菌的に加えたのち 滅菌シャーレに 分注し寒天平板として使用する 作製した寒天平板は冷蔵保存するが, その保存期 間は2~8 で7 日以内とする 典型的な O26 及びその他の血清群 (O157 を除く ) はピンク~ 赤紫色のコロニーを形成する 血清群 O157 及び大腸菌群は灰色 ~ 青色 を また 他のグラム陰性菌は無色のコロニーを形成する 添加剤 : 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg を加える 添加剤は日本ビオメリュー (200 ml 培地用 ) 関東化学 メルク ベリ タス等で購入することができる オ.CT-SMAC 寒天培地 ( 前述 ) カ. その他 血清群 O26 を同等に鑑別できる培地も使用できる 2 血清群 O111 セフィキシム 亜テルル酸カリウム添加ソルボースマッコンキー (CT-SBMAC) 寒天培地又 は CT-SMAC 寒天培地のうち1 種類を必ず使用する CT-SBMAC 寒天培地では 典型的な血清 群 O111 の形成するソルボース非分解又は遅分解の無色透明コロニー CT-SMAC 寒天培地で は 典型的な大腸菌コロニーを釣菌して 8 以降の血清型別試験を行う また 酵素基質培地として クロモアガー STEC 培地 CIX 寒天培地 Vi EHEC 培地 XM-EHEC 寒天培地等のうち1 種類以上を併用する ア.CT-SBMAC 寒天培地 ( 市販生培地 : 日水製薬 極東製薬工業等 ; 自家調製又は基礎培地 使用 ( マッコンキー基礎培地を用いる場合 : 日本ベクトン ディッキンソン等 )) 基礎培地組成 : ペプトン胆汁酸塩ソルボース ニュートラルレッドクリスタルバイオレット寒天 20.0 g 1.5 g 0.03 g g 1 7.2±0.1 又は マッコンキー基礎培地ソルボース 40.0 g 7.1±0.2 備考 :121 で 15 分間滅菌後 50 以下に冷却し 以下に示す添加剤を無菌的に加え たのち 滅菌シャーレに分注し寒天平板として使用する 典型的な血清群 O111 は ソルボース非分解又は遅分解コロニーであり無色透明コロニーを形成する 10
12 添加剤 : 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる イ.CT-SMAC 寒天培地 ( 前述 ) ウ. クロモアガー STEC 培地 ( 市販生培地又は粉末培地使用 : クロモアガー社製造 ; 関東 化学販売 ) 基礎培地組成 : ペプトン及び酵母エキス 特殊酵素基質混合物寒天 8.0 g 5.2 g 2.6 g 1 7.0±0.2 備考 : 加熱溶解後 ( オートクレーブ不可 過度の加熱も避けること )50 以下に冷却 してから添付のクロモアガー STEC サプリメント ( 選択剤混合物 25 mg/ バイアル ) を2 本加え 滅菌シャーレに分注し寒天平板を作製する なお 作製した寒天平板 は冷蔵保存するが その保存期間は 2~8 で 30 日以内とする 典型的な血清群 O111 は藤色コロニーを形成する また 血清群 O26 O157 O121 などの一部血清群の大 腸菌も藤色コロニーを形成する エ.CIX 寒天培地 ( 市販生培地 : 極東製薬工業 ) 組成 : カゼインペプトン胆汁酸塩糖類 寒天酵素基質 2 種選択剤混合物 指示薬 9.7 g 1.5 g g 2.55 mg 0.03 g 7.5±0.1 備考 : 保存期間は 2~10 で3ヶ月以内とする 典型的な血清群 O111 は群青色 ~ 濃 紫色コロニーを形成する また 血清群 O26 も群青色 ~ 濃紫色コロニーを形成する 血清群 O157 は青 ~ 青緑色のコロニーを形成する オ.Vi EHEC 培地 ( 市販生培地 : 栄研化学 ) 組成 : ペプトン胆汁酸塩 酵素基質混合物選択剤寒天 13.5 g 1.2 g 6.1 g g 19.0g 11
13 7.2±0.2 備考 : 保存期間は 2~10 で2ヶ月以内とする 典型的な血清群 O111 はえんじ色コロニーを形成する また 血清群 O26 は緑色 O157 は無色透明で中心部褐色のコロニーを形成する カ.XM-EHEC 寒天培地 ( 市販生培地 : 日水製薬 ) 組成 : ペプトン g 胆汁酸塩 1.8 g ソルビトール 1 発色酵素基質混合物 0.24 g 選択剤 5.05 mg 寒天 13.0 g 7.2±0.2 備考 : 保存期間は4~10 で 2.5 ヶ月以内とする 典型的な血清群 O111 は白濁した赤紫 ~ 紫色コロニーを形成する また 血清群 O26 は青紫色コロニーを 血清群 O157 は赤紫 ~ 紫色コロニーを形成する キ. その他 血清群 O111 を同等に鑑別できる酵素基質培地も使用できる 3 血清群 O157 CT-SMAC 寒天培地を必ず使用する また 酵素基質培地として BCM O157 寒天培地 クロモアガー O157 培地 クロモアガー O157TAM 培地 CT-O157:H7ID 寒天培地 レインボーアガー 0157 培地のうち 1 種類以上を併用する ア.CT-SMAC 寒天培地 ( 前述 ) イ.BCM O157 寒天培地 ( 栄研化学 ) 基礎培地組成 : トリプトン 6.0 g ポリペプトン 12.0 g 糖類 ( 単糖類 二糖類 ) 40.0 g 発色基質 0.4 g グラム陽性菌抑制剤 1.5 g フェノールレッド 0.1 g 寒天 1 添加剤 ( 亜テルル酸カリウム ) 0.5 mg 6.8±0.1 備考 : 加熱溶解後 ( オートクレーブ不可 )50 以下に冷却してから亜テルル酸カリウムを加え 滅菌シャーレに分注し寒天平板を作製する なお, 選択性を高めるには ノボビオシンナトリウムを目的にあわせて (10 mg/) 添加するとよい 作製した寒天平板は冷蔵保存するが その保存期間は 2~10 で 90 日以内とする 12
14 典型的な血清群 O157 は黒 ~ 濃緑色コロニーを形成する ウ. クロモアガー O157 培地 ( クロモアガー製造 ; 関東化学販売 ) 組成 : ペプトン 酵母エキス 3.0 g 選択剤 発色基質混合物 1.0 g 寒天 1 6.8±0.1 備考 : 加熱溶解後 ( オートクレーブ不可 過度の加熱も避けること )50 以下に冷却してから滅菌シャーレに分注し寒天平板を作製する なお 選択性を高めるには 添加剤 ( 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg) を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる 作製した寒天平板は冷蔵保存するが その保存期間は 2~8 で 30 日以内とする 典型的な血清群 O157 は藤色コロニーを形成する エ. クロモアガー O157 TAM 培地 ( クロモアガー製造 ; 関東化学販売 ) 組成 : ペプトン 酵母エキス 3.0 g 選択剤 発色基質混合物 1.0 g チオ硫酸ナトリウム 鉄混合物 寒天 12.0g 6.8±0.1 備考 : 加熱溶解後 ( オートクレーブ不可 過度の加熱も避けること )50 以下に冷却してから滅菌シャーレに分注し寒天平板を作製する なお 選択性を高めるには 添加剤 ( 培地 に対し セフィキシム 0.05 mg 亜テルル酸カリウム 2.5 mg) を加える 添加剤は関東化学 メルク ベリタス等で購入することができる 作製した寒天平板は冷蔵保存するが その保存期間は 2~8 で 30 日以内とする 典型的な血清群 O157 は藤色コロニーを形成する オ. レインボーアガー O157 培地 ( バイオログ製造 ; セントラル科学貿易販売 ) 組成 : ペプトン 6.0 g 糖類 g 発色基質 0.4 g 3-indoxyl-β-D-galactoside 0.25 g 3-indoxyl-β-D-glucuronide 0.12 g 寒天 14.0 g 6.8±0.1 13
15 備考 : 加熱溶解又は 121 で5 分間滅菌した後 50 以下に冷却してから滅菌シャーレに分注し寒天平板を作製する なお 選択性を高めるためには ノボビオシンナトリウムを目的にあわせて培地 あたり 100 mg 添加するとよい ただし 血清群 O157 以外の大腸菌も生育させる場合は 10 mg の添加とする 作製した寒天平板は冷蔵保存するが その保存期間は2~8 で 14 日以内とする 典型的な血清群 O157 は黒 ~ 灰色コロニーを形成する カ. その他 血清群 O157 を同等に鑑別できる酵素基質培地も使用できる 8. 血清型別試験分離平板培地から血清群 O26 O111 又は O157 と疑われるコロニーを釣菌し 普通寒天培地等にて純培養する ( 培養条件 :36±1 で 18~24 時間 ) 市販の免疫血清及び抗体を感作したラテックスを使用した凝集試薬を用いて 仕様書の試験方法を参照し血清型別試験を行う なお 免疫血清を使用する場合には 生菌を用いた場合に誤判定となることがあるため 最終判定には加熱死菌を用いる 1) 血清群 O26 (1) 病原大腸菌免疫血清 O26 ( デンカ生研 ) (2) E. coli O26-F 生研 ( デンカ生研 ) 2) 血清群 O111 (1) 病原大腸菌免疫血清 O111 ( デンカ生研 ) (2)E. coli O111-F 生研 ( デンカ生研 ) 3) 血清群 O157 (1) 病原大腸菌免疫血清 O157 ( デンカ生研 ) (2) 大腸菌 O157 検出試薬 UNI ( オキソイド製造 ; 関東化学販売 ) (3)E. coli O157-F 生研 ( デンカ生研 ) 4) その他 各血清群につき 同等品も使用できる 9. 生化学的性状試験血清群 O26 O111 及び O157 と疑われるコロニーについては 生化学的性状を確認する TSI 寒天培地 LIM 培地 CLIG 培地 各種キット等から選択して使用できる ( 培地使用における培養条件 :36±1 で 18~24 時間 ) 1)TSI 寒天培地 ( 日水製薬 栄研化学 メルク オキソイド製造 ; 関東化学販売 他 ) 組成 : ペプトン 20.0 g 肉エキス 3.0 g 酵母エキス 3.0 g 乳糖 ショ糖 ブドウ糖 1.0 g クエン酸鉄アンモニウム 0.2 g 14
16 チオ硫酸ナトリウムフェノールレッド寒天 0.2 g 24 mg 12.0 g 7.4±0.2 備考 : 加温溶解後 小試験管に3ml ずつ分注し 121 で 15 分間滅菌後 斜面寒天 ( 半高 層 ) として使用する 市販品を使用してもよい TSI 寒天培地での大腸菌は 高層部黄 変 斜面部黄変 硫化水素非産生 ガス産生を示す 2)LIM 培地 ( 日水製薬 極東製薬工業 栄研化学他 ) 組成 : ペプトン酵母エキスブドウ糖 L-リジン塩酸塩 L-トリプトファンブロムクレゾールパープル寒天 12.8 g 3.0 g 1.0 g 0.5 g 0.02 g 2.7 g 6.8±0.2 備考 : 加温溶解後 小試験管に約 5ml ずつ分注し 121 で 15 分間滅菌後 急冷し高層培 地とする 多くの大腸菌は 高層部紫色変 運動性陽性 インドール産生を示すが 高 層部黄色変 ( 血清群 O111 の多くの株 ) 運動性陰性など 非定型の性質を持つ場合もあ ることから これらについても大腸菌の性状として検査する 3)CLIG 培地 ( 極東製薬工業 ) 組成 : カゼインペプトン肉ペプトンラクトースセロビオーストリプトファン MUG フェノールレッド寒天 7.5 g 2.5 g 1.0 g 0.1 g 0.02 g g 14.9 g 7.4±0.2 備考 : 加温溶解後 小試験管に約 3ml ずつ分注し 115 で 15 分間滅菌後 斜面寒天 ( 半 高層 ) 培地とする 大腸菌は高層部黄変 斜面部赤変を示す 典型的な血清群 O157 は 紫外線照射下で蛍光を示さないが それ以外の血清型は蛍光を示す 10. VT 確認試験 15
17 血清群 O26 O111 又は O157 と疑われるコロニーについては VT 遺伝子又は VT 産生性を以下の方法で確認する 1)PCR 法 (1)O-157( ベロ毒素遺伝子 )PCR Screening Set( タカラバイオ ) (2)O-157( ベロ毒素 1 型 2 型遺伝子 )PCR Typing Set( タカラバイオ ) (3) その他 6.VT 遺伝子検出法で示した検出法及び同等品も使用できる 2) 逆受身ラテックス凝集反応 (RPLA) 法 (1)VTEC-RPLA 生研 ( デンカ生研 ) (2) その他 同等品も使用できる なお 増菌培養液での VT 遺伝子検出試験の代替には使用できない 3) イムノクロマトグラフィー法等 (1) デュオパス ベロトキシン ( メルク製造 : 極東製薬工業販売 ) (2) キャピリア VT( タウンズ ) (3)NH イムノクロマト VT1/2( 日本ハム製造 : 日水製薬 和光純薬工業 極東製薬工業 コスモ バイオ販売 ) (4)RIDA スクリーンベロトキシン ( アヅマックス ) (5) その他 同等品も使用できる なお 増菌培養液での VT 遺伝子検出試験の代替には使用できない 11. 判定腸管出血性大腸菌血清群 O26 O111 又は O157 が分離されたことをもって 陽性とする VT 遺伝子検出法によって陽性であったが 血清群 O26 O111 又は O157 の分離ができなかった場合は 陰性とする 16
18 17 ( 参考 )
2
2 3 4 TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT
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堺市における腸管出血性大腸菌 (EHEC) による感染症の発生動向 - 平成 27(2015) 年度 - 下迫純子 杉本光伸 福田弘美 岩崎直昭 木村友美 横田正春 小林和夫 要旨堺市内における平成 27 年度の腸管出血性大腸菌 (EHEC) 感染症の発生状況は 13 事例 感染者 20 名であった 12 名が下痢 腹痛等を呈し 8 名は無症状病原体保有者であった 溶血性尿毒症症候群 (HUS) を発症した者は
DNA Fragmentation Kit
研究用 DNA Fragmentation Kit 説明書 v201712da 本製品は 超音波破砕装置などの特殊な装置を使用せず 酵素処理によってゲノム DNA 等の長鎖 DNA をランダムに断片化し さらに平滑化するためのキットです 平滑化した断片はそのまま平滑末端ベクターに組み込むことができます また 平滑化を必要としない場合は 断片化までで反応を止めることもできます メチル化 DNA 濃縮や高速シーケンス解析のための前処理にも
PrimeScript RT reagent Kit (Perfect Real Time)
製品コード RR037A PrimeScript RT reagent Kit (Perfect Real Time) 説明書 本製品は リアルタイム RT-PCR に最適化された逆転写反応キットです 伸長性能に優れた PrimeScript RTase を使用し短時間の反応で効率良くリアルタイム PCR 用の鋳型 cdna を合成することができます 実験操作も簡単でハイスループットな解析にも適しています
2017 年 2 月 27 日 Myco Finder バリデーションデータ 日水製薬株式会社 研究部
2017 年 2 月 27 日 Myco Finder バリデーションデータ 日水製薬株式会社 研究部 1. 概要 マイコプラズマ遺伝子検出キット (Myco Finder) の性能を評価するために 下記ふたつの情報を参 考にバリデーションデータを取得した 1. 第十七改正日本薬局方 ( 平成 28 年 3 月 7 日厚生労働省告示 64 号 ) 参考情報 バイオテクノロジー応用医薬品 / 生物起源由来医薬品の製造に用いる細胞基材に対するマイコ
平成 24 年度外部精度管理調査結果 平成 24 年度の細菌試験 水質試験に関する試験検査精度管理調査を実施し その結果を平成 24 年 12 月 19 日に開催した試験検査精度管理委員会において協議した ( 平成 24 年度の委員名簿は表 1 のとおり ) 調査の結果を報告する 氏名所属 職名氏名
平成 24 年度外部精度管理調査結果 平成 24 年度の細菌試験 水質試験に関する試験検査精度管理調査を実施し その結果を平成 24 年 12 月 19 日に開催した試験検査精度管理委員会において協議した ( 平成 24 年度の委員名簿は表 1 のとおり ) 調査の結果を報告する 氏名所属 職名氏名所属 職名 平井義一自治医科大学医学部教授小林延年保健福祉部健康増進課長 柳原尚久帝京大学理工学部教授田辺悦夫保健福祉部生活衛生課長
Gen とるくん™(酵母用)High Recovery
研究用 Gen とるくん ( 酵母用 ) High Recovery 説明書 v201510da Gen とるくん ( 酵母用 )High Recovery は 細胞壁分解酵素による酵母菌体処理と塩析による DNA 精製の組み合わせにより 効率良く酵母ゲノム DNA を抽出 精製するためのキットです 本キットを用いた酵母ゲノム DNA 調製操作は 遠心による酵母菌体の回収 GenTLE Yeast
PrimeScript® II 1st strand cDNA Synthesis Kit
研究用 PrimeScript II 1st strand cdna Synthesis Kit 説明書 v201208da 目次 I. 概要... 3 II. キットの内容... 4 III. 保存... 4 IV. 1st-strand cdna 合成反応... 5 V. RT-PCR を行う場合... 6 VI. RNA サンプルの調製について... 6 VII. 関連製品... 7 VIII.
Perl + α. : DNA, mrna,,
2009 Perl + α. : DNA, mrna,, DNA .. DNA A C G T DNA 2 A-T, C-G DNA NH 2 NH 2 O - O O N P O - O CH 2 O N N O - O P O CH 2 O N O - O O P O NH 2 O - O - N CH 2 O N O OH OH OH DNA or RNA (U) (A) (G) (C)
Cytotoxicity LDH Assay Kit-WST
ytotoxicity L ssay Kit-WST はじめに 本説明書は ytotoxicity L ssay Kit-WST を用いた抗体依存性細胞傷害測定用 (ntibody-dependent cellmediated cytotoxicity: ) です 本製品のキット内容や Working Solution の調製方法に関して 製品添付の取扱い説明書も合わせてご覧ください 正確な測定のために
ChIP Reagents マニュアル
ChIP Reagents ~ クロマチン免疫沈降 (ChIP) 法用ストック溶液セット ~ マニュアル ( 第 1 版 ) Code No. 318-07131 NIPPON GENE CO., LTD. 目次 Ⅰ 製品説明 1 Ⅱ セット内容 1 Ⅲ 保存 2 Ⅳ 使用上の注意 2 Ⅴ 使用例 2 < 本品以外に必要な試薬 機器など> 2 1) 磁気ビーズと一次抗体の反応 3 2)-1 細胞の調製
組織からのゲノム DNA 抽出キット Tissue Genomic DNA Extraction Mini Kit 目次基本データ 3 キットの内容 3 重要事項 4 操作 4 サンプル別プロトコール 7 トラブルシューティング 9 * 本製品は研究用です *
組織からのゲノム DNA 抽出キット Tissue Genomic DNA Extraction Mini Kit 目次基本データ 3 キットの内容 3 重要事項 4 操作 4 サンプル別プロトコール 7 トラブルシューティング 9 * 本製品は研究用です * 2 本キットは動物の組織からトータル DNA を迅速に効率よく抽出するようにデザインされています また 細菌 固定組織 酵母用のプロトコールも用意しています
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Ⅳ. サルモネラの検査法 サルモネラは医学および獣医学における重要な病原菌である 本菌は腸内細菌科 (Enterobacteriaceae) に属するグラム陰性無芽胞桿菌で 一般に周毛性の鞭毛を有し運動性を示す 病原性の面からサルモネラをみるとヒトにチフス症を起こすものと胃腸炎を起こすものに大別される サルモネラは家畜や家禽およびイヌ ネコ 小鳥等のペット動物 さらにカメ ヘビなどの爬虫類の腸管内に保菌されているばかりでなく
目 次 1. はじめに 1 2. 組成および性状 2 3. 効能 効果 2 4. 特徴 2 5. 使用方法 2 6. 即時効果 持続効果および累積効果 3 7. 抗菌スペクトル 5 サラヤ株式会社スクラビイン S4% 液製品情報 2/ PDF
サラヤ株式会社スクラビイン S4% 液製品情報 1/8 52-0198-01-4PDF 目 次 1. はじめに 1 2. 組成および性状 2 3. 効能 効果 2 4. 特徴 2 5. 使用方法 2 6. 即時効果 持続効果および累積効果 3 7. 抗菌スペクトル 5 サラヤ株式会社スクラビイン S4% 液製品情報 2/8 52-0198-01-4PDF 1. はじめに 医療関連感染の原因となる微生物の多くは
3M フードセーフティ製品 総合カタログ
3M http://www.mmm.co.jp/microbiology/howto/index.html 200 65 1600 1400 1200 1000 800 600 400 0.992 200 0 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 E.Coli 83 45 46 16 AOAC FDA-BAM USDA MLG ISO Global Standard NIHSJ
無細胞タンパク質合成試薬キット Transdirect insect cell
発現プラスミドの構築 1. インサート DNA の調製開始コドンは出来るだけ 5'UTR に近い位置に挿入して下さい 経験的に ptd1 の EcoRV/KpnI サイトへのライゲーション効率が最も高いことを確認しています 本プロトコルに従うと インサートサイズにも依りますが 90% 以上のコロニーがインサートの挿入されたクローンとして得られます 可能な限り EcoRV/KpnI サイトへ挿入されるお奨めします
Microsoft Word - ケミストリープロトコル_v5_2012_Final.doc
GenomeLab GeXP Genetic Analysis System Sequenci Chemistry Protocol シークエンスケミストリープロトコル V.5 1. 反応試薬と消耗品について 1-1. 弊社供給試薬 製品名製品番号保存条件 DTCS クイックスタートキット (100 反応 ) 608120-20 DTCS クイックスタートキットに含まれている試薬キット内の試薬はミネラルオイル以外
ISOSPIN Blood & Plasma DNA
血液 血清 血しょうからの DNA 抽出キット ISOSPIN Blood & Plasma DNA マニュアル ( 第 2 版 ) Code No. 312-08131 NIPPON GENE CO., LTD. I 製品説明 ISOSPIN Blood & Plasma DNA( アイソスピンブラッド & プラズマ DNA) は 血液 血清 血しょうから DNAを抽出するためのキットです 本キットは
4-4 in situ PCR 研究室 in situ PCR 標的菌種と遺伝子 ( 報告年 ) 応用 Dept. of Marine Sciences University of Georgia USA Escherichia coli O157slt II Escherichia coli 16SrDNA Ralstonia eutropha phl (1997,1998,1999,2002)
Microsoft Word - ボツリヌス病原体検査マニュアル docx
I ---- 3 1. ---- 4 2. ---- 5 II ---- 12 1. ---- 12 2. ---- 12 3. ---- 16 4. ---- 17 5. ---- 21 6. PCR ---- 25 III ---- 28 IV ---- 32 V ---- 34 VI ---- 35 ---- 10 ---- 12 ---- 15 ---- 24 PCR ---- 26
リアルタイムPCRの基礎知識
1. リアルタイム PCR の用途リアルタイム PCR 法は 遺伝子発現解析の他に SNPs タイピング 遺伝子組み換え食品の検査 ウイルスや病原菌の検出 導入遺伝子のコピー数の解析などさまざまな用途に応用されている 遺伝子発現解析のような定量解析は まさにリアルタイム PCR の得意とするところであるが プラス / マイナス判定だけの定性的な解析にもその威力を発揮する これは リアルタイム PCR
Human Housekeeping Gene Primer Set, Mouse Housekeeping Gene Primer Set, Rat Housekeeping Gene Primer Set
研究用 Human Housekeeping Gene Primer Set ( 製品コード 3790) Mouse Housekeeping Gene Primer Set ( 製品コード 3791) Rat Housekeeping Gene Primer Set ( 製品コード 3792) 説明書 v201710da 通常 リアルタイム RT-PCR による遺伝子発現解析は相対定量により行われ
手順 ) 1) プライマーの設計 発注変異導入部位がプライマーのほぼ中央になるようにする 可能であれば 制限酵素サイトができるようにすると確認が容易になる プライマーは 25-45mer で TM 値が 78 以上になるようにする Tm= (%GC)-675/N-%mismatch
Mutagenesis 目的 ) 既存の遺伝子に PCR を利用して変異を導入する 1 点変異導入方法 ) Quik Change Site-Directed Mutagenesis Kit(Stratagene) のプロトコールを流用 http://www.stratagene.com/products/showproduct.aspx?pid=131 Kit 中では DNA polymerase
PrimeSTAR® Mutagenesis Basal Kit
PrimeSTAR Mutagenesis Basal Kit 説明書 v201107da 目次 I. キットの内容...3 II. 保存...3 III. 本システムの原理...3 IV. プライマー設計について...5 V. 操作...8 VI. 実験例...10 VII. トラブルシューティング...13 VIII. 関連製品...13 IX. 注意...13 2 PrimeSTAR Mutagenesis
