β Aspergillus Aspergillus
β in vitro in vivo α γ α
γδ Streptococcus suis
S. suis
Chlamydia trachomatis
C. trachomatis C. trachomatis C. trachomatis Chlamydia Helicobacter pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori
in vitro in vitro in vitro
Staphylococcus aureus mec mec β β
Ixodes scapularis Borrelia burgdorferi Ixodes persulcatus Ixodes ovatus B. burgdorferi
B. garinii B. afzelii B. burgdorferi B. garinii B. afzelii B. burgdorferi B. garinii
γ β γ γ γ γ
γ γ
α in vitro Mycobacterium avium
β β β
in vitro β β β β β β
β β β Helicobacter pylori
Picornaviridae Hepadnaviridae Flaviviridae Hepeviridae
ermb β pbp1a 2b 2x ermb mefa β β
asta
Streptococcus constellatus Bacteroides fragilis meca Corynebacterium amycolatum Streptococcus mitis S. sanguinis Treponema pallidum Prevotella melaninogenica Mycobacterium kansasii Campylobacter fetus fetus Helicobacter cinaedi
Chlamydophila psittaci Chlamydia trachomatis Chlamydophila pneumoniae C. psittaci C. psittaci C. psittaci
Bartonella henselae Bartonella clarridgeiae Bartonella koehlerae Bartonella vinsonii berkhoffii Bartonella elizabethae Bartonella grahamii Bartonella vinsonii arupensis Bartonella washoensis Bartonella alsatica B. henselae B. henselae B. clarridgeiae B. henselae B. henselae α
α α Clostridium perfringens agrb agrd agrbd agrbd virx virx spo0a sigf sige sigg virx virx virx α α α
α α α α α α γ α α β α α α α β in vivo
Bordetella ptxs1 prn fim3 Propionibacterium acnes αα µα µ µ α
α γ γ α γ α α α γ γ α α γ Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa oprd β bla bla β ampc gyra parc
Enterococcus faecium E. faecium 1546 1546 1546 vanr vans vanh vana vanx 1546 E. faecium 1546 E. faecalis E. faecalis E. faecalis
6110
β Streptococcus pyogenes S. pyogenes emm emm1 S. pyogenes emm1 emm emm49 S. pyogenes emm49 S. pyogenes emm49 ska csrs csrs csrs csrs
Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila pneumoniae β S. pyogenes Legionella pneumophila β ββ β β β β β β
β β β β β β β β β β
gyr parc cps
pbp1a pbp2b pbp2x erm pbp1a mef pbp1a mef erm mef
β µ β Trichosporon asahii µ µ µ µ β
Haemophilus influenzae H. influenzae H. influenzae H. influenzae β α H. influenzae TLR4 CD14 TNFα IL-6 IL-8RA B MAC1
CD14 TNFα IL-6 Staphylococcus aureus α S. aureus S. aureus α
Legionella pneumophila L. pneumophila L. pneumophila L. pneumophila L. pneumophila L. pneumophila κ L. pneumophila α β κ L. pneumophila κ Listeria monocyotogenes γ γ L. ivanovii γ γ γ hly hly hly : : hly hlyy : : ilo γ hlyy : : hly hlyy : : ilo hlyy : : hly γ hlyy : : ilo γ hlyy : : hly hlyy : : ilo hlyy : : hly hlyy : : ilo
hlyy : : hly hlyy : : ilo γ Mycobacterium avium Mycobacterium avium Φ Φ Φ Φ Φ Φ Φ Φ M. avium Φ Φ Φ Φ Φ φ Legionella pneumophila L. pneumophila φ b phox phox phox L. pneumophila φ L. pneumophila L. pneumophila L. pneumophila L. pneumophila Φ Φ Φ
Φ Φ α
α α
Haemophilus influenza
µ
Mycoplasma pneumoniae M. pneumoniae M. pneumoniae
Mycoplasma pneumoniae in vivo in vitro
in vitro
β
Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae S. pneumoniae H. influenzae S. pneumoniae H. influenzae S. pneumoniae H. influenzae
S. pneumoniae H. influenzae pbp1a pbp2x pbp2b mefa ermb S. pneumoniae H. influenzae β β
Clostridium difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile Clostridium difficile C. difficile C. difficile Clostridium difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile Sma C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile Clostridium difficile C. difficile C. difficile C. difficile
Clostridium difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile C. difficile Clostridium difficile C. difficile C. difficile β C. difficile C. difficile C. difficile Clostridium difficile C. difficile C.
difficile µ µ µ
Mycobacterium tuberculosis M. tuberculosis µ µ
γ M. kansasii M. szulgai Mycobacterium kansasii
Mycobacterium avium Mycobacterium kansasii α α γ α α γ µ γ γ γ
Enterococcus faecalis Enterococcus faecium
Streptococcus pneumoniae Streptococcus pneumoniae
Haemophilus influenzae Pseudomonas aeruginosa Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila pneumoniae Legionella M. pneumoniae C. pneumoniae Legionella C. pneumoniae M. pneumoniae Legionella pneumophila M. pneumoniae C. pneumoniae Legionella M. pneumoniae C. pneumoniae Legionella
Mycoplasma pneumoniae Corynebacterium ulcerans C. ulcerans
C. ulcerans Pseudomonas Acinetobacter Stenotrophonas maltophilia
Pseudomonas aeruginosa Serra-
tia Klebsiella pneumoniae Enterobacter aerogenes Helicobacter pylori H. pylori CagA H. pylori H. pylori H. pylori caga H. pylori caga H. pylori H. pylori 16S rrna urea caga H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori 16S rrna urea Helicobacter pylor
H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori Helicobacter hepaticus Helicobacter pylori Helicobacter Helicobacter Helicobacter H. hepaticus Helicobacter bilis H. hepaticus H. bilis Helicobacter rappini hepaticus µ H. hepaticus H. pylori H. hepaticus H. bilis H. hepaticus bfpa bfpa eae eae bfpa bfpa bfpa bfpa bfpf pera perc bfpa bfpf pera perc β
Xba β β β β
Salmonella Salmonella Salmonella Salmonella S S S S S S S S S S Salmonella µ Salmonella Salmonella
µ Salmonella S S S S
Edwardsiella tarda E. tarda E. tarda µ µ E. tarda E. tarda E. tarda Clostridium perfringens C. perfringens C. perfringens cpe Sma Not Pvu C. perfirngens cpe C. difficile cpe Sma cpe Sma Not Pvu cpe cpe Clostridium perfringens C. perfringens C. perfringens
C. perfringens E. coli Aspergillus fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus in vitro in vivo Aspergillus fumigatus Stachybotrys chartarum S. chartarum
S. chartarum S. chartarum S. chartarum Candida albicans Candida glabrata Candida tropicalis Candida parapilosis Trichosporon asahii Candida albicans β C. albicans C. toropicalis β
Candida Candida albicans Candida glabrata Candida parapsilosis C. albicans albicans Candida Aspergillus Aspergillus fumigatus Aspergillus niger Aspergillus terreus Aspergillus flavus A. fumigatus albicans Candida Candida albicans Candida glabrata Candida tropicalis Candida parapsilosis Candida krusei C. albicans C. glabrata C. tropicalis C. krusei albicans parapsilosis tropicalis C. albicans C. albicans C. parapsilosis C. krusei C. tropicalis C. glabrata Trichosporon asahii T. asahii T. asahii β
T. asahii T. asahii T. asahii Candida intermedia Candida albicans albicans Candida Candida C. intermedia Cryptococcus humicolus β Cryptococcus sp. C. intermedia C. intermedia Candida C. intermedia C. intermedia β β
Trichosporon Cryptococcus β β β β β β Pneumocystis jiroveci P. jiroveci β β β β β β β β in vitro β
Pseudomonas aeruginosa P. aeruginosa Streptococcus sanguis S. sanguis S. sanguis S. sanguis µ S. sanguis Escherichia coli Klebsiella Enterobacter Seratia Citrobacter freundii Proteus group Acinetobactor baumanii A. baumanii S. sanguis in vi-
tro in vivo in vivo in vitro in vivo β β in vitro β β in vitro β
µ µ µ
Salmonella Salmonella Cryptococcus neoformance µ C. neoformance C. neoformance µ C. neoformance C. neoformance C. neoformance C. neoformance C. neoformance C. neoformance
µ µ µ µ µ µ
µ µ p µ µ
Bis bis bis µ bis bis
Streptococcus pyogenes Streptococcus salivarius S. pyogenes S. salivarius S. pyogenes S. salivarius S. pyogenes S. pyogenes S. salivarius S. salivarius S. pyogenes S. pyogenes S. salivarius S. pyogenes S. pyogenes S. salivarius
emm emm emm emm emm µ β Streptococcus mitis S. mitis
Streptococcus µ µ Proteus mirabilisenterococcus faecalis
Streptococcus equisimlis Streptococcus dysgalactiae equisimilis S. equisimilis S. equisimilis S. equisimilis S. equisimilis Streptococcus S. equisimilis S. equisimilis S. equisimlis S. equisimilis S. equisimilis Legionella pneumophila L. pneumophila Legionella pneumophila Acanthamoeba culbertsoni A. culbertsoni Coxiella burnetii C. burnetii C. burnetii λ in vivo
C. burnetii Coxiella burnetii C. burnetii Coxiella burnetii C. burnetii C. burnetii Bartonella henselae B. henselae
B. henselae B. henselae B. henselae B. henselae B. henselae B. henselae B. henselae Escherichia coli E. coli E. coli Pseudomonas aeruginosa Klebsiella oxytoca Klebsiella pneumoniae
Serratia marcescens S. marcescens S. marcescens Haemophilus influenzae β H. influenzae β Haemophilus influenzae H. influenzae
Streptobacillus moniliformis S. moniliformis Rattus S. moniliformis S. moniliformis R. norvenics R. rattus S. moniliformis S. moniliformis S. moniliformis S. moniliformis Capnocytophaga canimorsus C. canimorsus Capnocytophaga Capnocytophaga C. canimorsus C. canimorsus C. canimorsus C. canimorsus Bacillus Bacillus Bacillus Bacillus Bacillus Bacillus Bacillus Bacillus
Bacillus Bacillus Shewanella algae S. algae Shewanella µ Shewanella S. algae S. algae Helicobacter pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori H. pylori
Desulfovibrio desulfricans D. fairfieldensis D. fairfieldensis D. desulfricans D. desulfricans D. fairfieldensis Fusobacterium nucleatum µ µ F. nucleatum F. nucleatum F. nucleatum cpe cpe cpe cpe cpe cpa cpe cpe cpe D cpe cpe cpe cpe cpe cpe cpe cpe
C.p. C.p. C.p. C.p. C.p. C.p. flab Leptospira interogans L. borgpetersenii
L. interogans Borrelia valaisiana Borrelia duttonii B. duttonii B. duttonii Borrelia hermsii Rickettsia japonica
Rickettsia japonica Rickettsia rickettsii Rickettsia conorii Rickettsia sibirica R. japonica R. japonica R. japonica Rickettsia japonica R. japonica R. japonica R. japonica R. japonica Rickettsia japonica
β β Aspergillus fumigatus Aspergillus niger Aspergillus fumigatus Aspergillus flavus β
β β Schizophyllum commune
S. commune S. commune S. commune γ gp91phox CYBB µ Asperigillus fumigatus β γγ γ Candida albicans C. albicans C. albicans C. albicans
Trichosporon asahii Cryptococcus neoformance Candida albicans Candida glabrata Candida tropicalis Candida parapsilosis Candida krusei C. albicans µ C. albicans C. glabrata
Staphylococcus aureus Pseudomonas aeruginosa Stenotrophomonas maltophilia Enterococcus faecium Enterobacter cloacae Legionella longbeachae Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila psitacii Streptococcus pneumoniae
Haemofilus influenzae Klebsiella pneumoniae H. influenzae Legionella anisa α Legionella pneumophila L. anisa L. pneumophila L. anisa L. pneumophila
Enterococcus faecalis Staphyrococcus epidermidis E. facalis β
Bordetella pertussis Haemophilus parainfluenzae B. pertussis
Staphylococcus Staphylococcus aureus Moraxella catarrhalis Bacillus cereuscorynebacterium
B. cereus Stenotrophomonas maltophilia Klebsiella pneumoniae Proteus mirabilis Serratia marcescens Staphylococcus epidermidis Staphylococcus aureus Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa S. aureus Streptococcus pneumoniae S. pneumoniae
S. pneumoniae Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Stenotrophomonas maltophilia S. maltophilia β S. maltophilia S. maltophilia
Shigella sonnei S. sonnei S. sonnei