プロテオーム解析において韓国で 3,000 件 / 年以上の実績を持つ韓国ジェノ マイン社のプロテオーム解析サービスを日本でも提供 ( 国内提供 : 株式会 社リバネス ) 日本国内では 160 名を超える登録者 約 1,000 サンプルの解析を実施 (2010 年 6 月以降の実績 ) 主な解析サービス PROTEOMICS SERVICE GENOMINE, Inc ジェノマインのタンパク質解析サービス PMF によるタンパク質の質量分析 タンパク質発現分析サービス (2 次元電気泳動分析 ) 質量分析によるタンパク質の修飾決定 etc.
GENOMINE HIGH RESOLUTION 2DE GELS SERVICE 高解像度の 2DE サービス 1 次元目 ( 等電点電気泳動 ) 2 次元目 (SDS-PAGE) サンプル量 IPG-IEF phレンジ : 3.5-10 NL, 4-7, 4.5-6.5, 6-8 10~16% グラジエントゲルを利用したSDS-PAGE < ゲルサイズ > 通常サイズ 18 x 20 cm 大型サイズ 26 x 20 cm 染色 : MALDI- TOF compatible alkaline silver staining, Coomassie Blue staining Analytical gels: 50-100 µg protein 細胞数 ( 重量 )10 5 cells, 1 mg tissue Semi preparative gels : 200 ug protein Preparative gels: up to 3 mg protein 細胞数 ( 重量 ) 10 6 cells, 10 mg tissue
SILVER STAINED 2DE 価格 : 59,300 (#D3010) <2 次元電気泳動 > 1 次元目 : 等電点電気泳動 (Immobilized ph Gradient 法, IPG 法 ) 実施 ジェノマイン独自に開発した等電点電気泳動用の IPG プレキャストゲルを利用して電気泳動を行います ゲルの種類は ph3.5-10 ph4-7 ph4.5-6.5 ph6-8 ph7-9 がございます 2 次元目 : 26 X 20cm の 10-15% グラジエントゲルを使った SDS-PAGE の実施 < 染色 > 銀染色法 ( 検出限界は 1-2ng/ スポット ) < 検出 / 結果の提供 > ソフトウェア (PDQuest v7.02(biorad)) による自動 spot match を行い タンパク質の発現量に変化が見られるスポットに関しては その部分にフォーカスした画像データをご提供いたします マスターゲルにある全てのスポットには固有番号が付与され 解析を通して同じスポット番号として管理されます 2 次元電気泳動の実施プロトコルのほか ゲルのイメージファイルに ph 勾配 分子量を記載したデータとともにご提供いたします データに関しては 論文データとしてそのまま利用できるイメージファイルをお送りいたします < その他 > 1 次元目の ph 勾配に関してはカスタムメイドも可能ですので ご希望の際はお問い合わせください 分子量マーカーをコントロールのゲルに一緒に流すことも可能ですので 必要な場合はご相談ください COOMASSIE BLUE STAINED 2DE GEL 価格 : 59,300 (#D3011) <2 次元電気泳動 > 1 次元目 : 等電点電気泳動 (Immobilized ph Gradient 法, IPG 法 ) 実施 ジェノマイン独自に開発した等電点電気泳動用の IPG プレキャストゲルを利用して電気泳動を行います ゲルの種類は ph3.5-10 ph4-7 ph4.5-6.5 ph6-8 ph7-9 がございます 2 次元目 : 26 X 20cm の 10-16% グラジエントゲルを使った SDS-PAGE の実施
< 染色 > CBB-R によるタンパク質染色 ( 検出限界は 100-200ng/ スポット ) < 検出 / 結果の提供 > ソフトウェア (PDQuest v7.02(biorad)) による自動 spot match を行い タンパク質の発現量に変化が見られるスポットに関しては その部分にフォーカスした画像データをご提供いたします マスターゲルにある全てのスポットには固有番号が付与され 解析を通して同じスポット番号として管理さ れます 2 次元電気泳動の実施プロトコルのほか ゲルのイメージファイルに ph 勾配 分子量を記載したデータとともにご提供いたします データに関しては 論文データとしてそのまま利用できるイメージファイルをお送りいたします < その他 > 1 次元目の ph 勾配に関してはカスタムメイドも可能ですので お問い合わせください 分子量マーカーをコントロールのゲルに一緒に流すことも可能ですので 必要な場合はご相談ください SILVER STAINED 2DE GEL PLUS SPOT QUANTIFICATION 価格 : 71,600 (#D3012) <2 次元電気泳動 > 1 次元目 : 等電点電気泳動 (Immobilized ph Gradient 法, IPG 法 ) 実施 ジェノマイン独自に開発した等電点電気泳動用の IPG プレキャストゲルを利用して電気泳動を行います ゲルの種類は ph3.5-10 ph4-7 ph4.5-6.5 ph6-8 ph7-9 がございます 2 次元目 : 26 X 20cm の 10-15% グラジエントゲルを使った SDS-PAGE の実施 < 染色 > 銀染色によるタンパク質染色 ( 検出限界は 1-2ng/ スポット ) < 検出 / 結果の提供 > ソフトウェア (PDQuest v7.02(biorad)) による自動 spot match を行い タンパク質の発現量に変化が見られるスポットに関しては その部分にフォーカスした画像データをご提供いたします マスターゲルにある全てのスポットには固有番号が付与され 解析を通して同じスポット番号として管理されます タンパク質発現量の変化が 2 倍以上あったスポットに関してはスポット強度の基準値を提供いたします
2 次元電気泳動の実施プロトコルのほか ゲルのイメージファイルに ph 勾配 分子量を記載したデータとともにご提供いたします データに関しては 論文データとしてそのまま利用できるイメージファイルをお送りいたします < その他 > 1 次元目の ph 勾配に関してはカスタムメイドも可能ですので お問い合わせください 分子量マーカーをコントロールのゲルに一緒に流すことも可能ですので 必要な場合はご相談ください SILVER STAINED 2DE GEL + EXPRESSION PATTERN CLASSIFICATION 価格 : 89,800 (#D3013) <2 次元電気泳動 > 1 次元目 : 等電点電気泳動 (Immobilized ph Gradient 法, IPG 法 ) 実施 ジェノマイン独自に開発した等電点電気泳動用の IPG プレキャストゲルを利用して電気泳動を行います ゲルの種類は ph3.5-10 ph4-7 ph4.5-6.5 ph6-8 ph7-9 がございます 2 次元目 : 26 X 20cm の 10-15% グラジエントゲルを使った SDS-PAGE の実施 < 染色 > 銀染色によるタンパク質染色 ( 検出限界は 1-2ng) < 検出 / 結果の提供 > ソフトウェア (PDQuest v7.02(biorad)) による自動 spot match を行い タンパク質の発現量に変化が見られるスポットに関しては その部分にフォーカスした画像データをご提供いたします マスターゲルにある全てのスポットには固有番号が付与され 解析を通して同じスポット番号として管理されます タンパク質発現量の変化が 2 倍以上あったスポットに関してはスポット強度の基準値を提供いたします タンパク質全体の発現変化を階層クラスタリング 非階層クラスタリング 自己組織化マップで解析します < その他 > 1 次元目の ph 勾配に関してはカスタムメイドも可能ですので お問い合わせください 分子量マーカーをコントロールのゲルに一緒に流すことも可能ですので 必要な場合はご相談ください
MALDI-MS LC-MS/MS Ettan MALDI-TOF Q-TOF Excel GENOMINE MASS SPEC PLATFORM 高感度 (fmol オーダーでの検出 ) 精度 :< 10 ppm 全自動で MS を実施 MALDI-TOF/TOF 解析にも対応 LC-MS/MS 解析にも対応 WHOLE PROTEIN MASS ANALYSIS 解析にも対応 Protein modofication 分析 自動的に結果のスペクトルを分析し データベースとの照合を実施
MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS 価格 : 21,600 (#M4010) ペプチドマスフィンガープリンティング (PMF) によるタンパク質同定 MALDI-TOF MS によるゲル中 もしくは溶液中タンパク質の解析 ( ゲルの脱色 タンパク質のゲル内 消化 MS 分析 データベース検索が含まれます ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS 96well format 価格 : 20,100 (#M4011) ペプチドマスフィンガプリンティング (PMF) によるタンパク質同定 MALDI-TOFMS によるゲル中 もしくは溶液中タンパク質の解析 ( ゲルの脱色 タンパク質のゲル内消 化 MS 分析 データベース検索を含みます ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 96 ウェルプレート (96 ウェルプレート ) に入れてお送りください CAF-MALDI sequencing 価格 : 38,300 (#M4012) Chemically-assisted fragmentation MALDI-PSD 方式のタンパク質断片化とペプチドの検出によ るタンパク質同定 CAF を用いることでペプチドのフラグメント化が促進されます MALDI-TOFMS によるゲル中 もしくは溶液中タンパク質の解析 ( ゲルの脱色 タンパク質のゲル内消 化 MS 分析 データベース検索を含みます ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください LC-MS/MS MASS SPEC ANALYSIS 価格 : 73,600 (#M4013)
LC-MS/MS 方式のペプチドの断片化 LC-MS/MS によるゲル中 もしくは溶液中タンパク質の解析 ( ゲルの脱色 タンパク質のゲル内消化 MS 分析 データベース検索を含みます ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください MALDI-TOF/TOF(MS/MS) MASS SPEC ANALYSIS 価格 : 58,000 (#M4014) MALDI-TOF/TOF 方式のペプチドの断片化 MALDI-TOF/TOF によるゲル中 もしくは溶液中タンパク質の解析 ( ゲルの脱色 タンパク質のゲル内 消化 MS 分析 データベース検索を含みます ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください WHOLE PROTEIN MASS SPEC ANALYSIS 価格 : 21,600 (#M4015) MALDI-TOF による全体タンパク質の全体分子量を測定します MALDI-TOF を利用する PSD(POST-SOURCE DECAY) モード方式として溶液中のタンパク質全体の分子量を測定 した図と解釈の結果が提供されます < サンプル形態 > タンパク質が入っているバファー ( 組成の表記は必須 ) の濃度はせめて 0.7mg/ml くらいは必要で 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください. タンパク質の分子量が 80KDa 以下が測定に適切であり その以上は特性によって測定しにくい場合もあります MALDI-TOF MASS SPEC FOF MODIFICATION ANALYSIS 価格 : 43,200 (#M4016) MALDI-TOF を利用してタンパク質の変形 ( タンパク質の結合 メチール化など ) を分析します MALDI-TOF でゲルや溶液の中のタンパク質の変形について MS 分析を行います ( 解析の結果を含む ) < サンプル形態 > CBB 染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド ( もしくはスポット ) を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください
GENOMINE PHOSPHOPROTEIN ANALYSIS SERVICE 酵母全タンパク質 (CBB) Phosphoprotein Enrichment (CBB) Phosphoprotein Enrichment (ProQ) サービス 1: リン酸化タンパク質の染色 サービス 2:PMF によるリン酸化タンパク質の同定 サービス 3:PSD MALDI-TOF PSD によるリン酸化ペプチドの確認 サービス 4:MS/MS によるリン酸化部位の決定 サービス 5: リン酸化タンパク質の濃縮とリン酸化タンパク質特異的染色
サービス1 リン酸化タンパク質の染色サービス 価格 : 89,800 (#P8010,SDS-PAGE gel) Step1: タンパク質の2 次元電気泳動 : 小型ゲル 1 次元目等電点電気泳動 :ph4-10 (non linear IPG) 2 次元目 SDS-PAGE(10-15%) 98,800 (#P8011,2DE gel) Step2: 染色 : 方法 1: ProQのダイヤモンドの染色 (Molecular Probes) - 検出方法 : ProQの蛍光 (Ex/Em: 555/580nm) 使用フィルター : Ex/Em: Cy3/Cy3 方法 2: コロイドCBB 染色 Step3: 多重染色 (CBB & ProQ 染色 ) と spot の比較 Step4: ディファレンシャルディスプレイと比較解析の実施 Step1, 2: 酵母タンパク質のProQ 染色タンパク質 : 酵母全タンパク質染色法 1 : ProQ Diamond (Molecular Probes TM ) 2 : コロイドCBB 分離 : 等電点電気泳動,SDS-PAGE 検出 : ProQ fluorescence (Ex/Em: 555/580nm) Step3: 多重染色とスポットマッチング Synthetic image 全タンパク質 (CBB) リン酸化タンパク質 (ProQ) サンプル : 酵母全タンパク質 400ug 検出 :ProQ Diamond & CBB Step4: ディファレンシャルディスプレイ & 比較解析 DAE3 渣サンプル : シロイヌナズナ種子 検出 :ProQ Diamond & CBB DAE19 ProQ staining
サービス2 PMFによるリン酸化タンパク質の同定 価格 : 21,600 (#P8020) Step1 : PMF (Peptide Mass Fingerprinting) によるタンパク質の同定 Step2 : リン酸化ペプチドとして予測される質量値との比較によりリン酸化の可能性の予測 Step1 Synthetic image 全タンパク質 (CBB) リン酸化タンパク質 (ProQ) Step2 Spot ID Protein annotation MW/pI Predicted phosphorylation site 9101 Protein component of the small (40S) ribosomal subu 25.08/8.6 LTNSLMMNGR (2)+HPO3@STY; 0103 acetolactate synthase (EC 4.1.3.18) regulatory chain 34.31/6.1 GFNIDSLVVCNTEVKDLSR (1)+HPO3@STY; VVASSCATMVRCSSSSTSALAYK (4)+HPO3@STY 1101 elongation factor-1 beta 22.67/4.3 2202 BMH1 22.13/5.9 7304 Met17p 48.71/6.0 TKAVYLETIGNPK (3)+HPO3@STY 6505 Glk1p 55.76/5.8 GLPMIPAFVTGSPNGTER (1)+HPO3@STY 4302 glycerol-3-phosphate dehydrogenase 43.42/7.5 LIKDPTSGK (2)+HPO3@STY STKMIHGGVR (1)+HPO3@STY 3601 Hsp70 protein 58.33/4.9 TLEPIPK (1)+HPO3@STY EAVLTVPTNFSEEQK (2)+HPO3@STY 3804 ubiquitin-activating enzyme 114.85 3806 Silent information regulator 114.85 IDHTIAWAK (1)+HPO3@STY LTESYSSSRDPPEK (2)+HPO3@STY 6805 Elongation factor 3A (EF-3A) (EF-3) 116.83/5.7 LSVATADNR (2)+HPO3@STY 5401 Tif3p 48.5/5.2 GSNFQSSSRPPRR (1)+HPO3@STY 4501 Hexokinase isoenzyme 2 that catalyzes phosphorylati 54.15/5.2 HFISELEKGLSK (2)+HPO3@STY 8101 Protein component of the small (40S) ribosomal subu 25.08/8.6 1002 HFA1 92.83/6.3 LGELVGYVSAGTVEYLYSPK (1)+HPO3@STY 0102 GTP binding protein 24.96/8.6 RHLTGEFEK (1)+HPO3@STY 6101 Asc1p 34.90/5.8 LWDVATGETYQRFVGHK (3)+HPO3@STY
サービス 3 MALDI-TOF PSD によるリン酸化ペプチドの同定 価格 : 31,000 (#P8030) Step1 ( オプション ): PMF によるリン酸化ペプチドの予測 Step2 ( オプション ): PhosPep TM による ProQ 染色されたスポットからのリン酸化ペプチドの濃縮 Step3 : MALDI - TOF PSD を用いたリン酸化ペプチドの同定 Step1( 例 ) Synthetic image 酵母全タンパク質 (CBB) リン酸化タンパク質 (ProQ) Step3( 例 ) mono phosphopeptide Spot ID Protein annotation MW/pI Predicted phosphorylation site 9101 Protein component of the small (40S) ribosomal subu 25.08/8.6 LTNSLMMNGR (1)+HPO3@STY; Step2( 例 ) トリプシン消化 β カゼイン リン酸化タンパク質 (ProQ) Tetra phosphopeptide サービス 4 CAF sequencing によるリン酸化部位の決定 価格 : 56,400 (#P8040) Step1 : ProQ 染色されたスポットをトリプシンで切断後 SPITC 標識 Step2 : PhosPep TM によりリン酸化ペプチドを濃縮 Step3 : MALDI-TOF PSD を用いて CAF sequencing の後 リン酸化部位を決定
Step1 & 2 Step3 サービス 5 リン酸化タンパク質の濃縮を含むサービス 価格 : 107,800 (#P8050) 本サービスはジェノマインの独自技術を利用することで リン酸化タンパク質特異的に濃縮し 細胞内に少量しかないリン酸化タンパク質を回収する可能性を高めます Step1: PhosPro TM kit (Genomine の専有技術 ) を用いて細胞全体または組職分画タンパク質からリン酸化 タンパク質を濃縮 Step2: リン酸化タンパク質の染色 ( サービス 1 と同じ ) Synthetic image h460 全タンパク質 h460 リン酸化タンパク質濃縮画分 CBB ProQ(35 spot) CBB ProQ(198 spot) サンプル : 300 g h460 全タンパク質 サンプル : 300 g h460 リン酸化タン h460 リン酸化タンパク質濃縮残渣 CBB ProQ サンプル : 300 g h460 リン酸化タンパク質濃縮残
GENOMINE MEMBRANE BLOTTING SERVICE Membrane blotting with 2-D gel(8cm IPG strip) 価格 : 114,000 (#B1010) Membrane blotting with 2-D gel(12cm IPG strip) 価格 : 116,500 (#B1011) Membrane blotting with 2-D gel(24cm IPG strip) 価格 : 119,920 (#B1012) 二次元電気泳動のゲルを利用して PVDF Membrane にタンパク質を付けるサービスです ウェスタン全過程の代行では なく タンパク質を付けたMembraneは依頼者にご送付するようになります (TNTで配送, 配送費は依頼者のご負担となります ) ウェスタンの段階からシグナルが確認できたmembraneはイメージ画像をお送りいただくことで 該当ゲルでのどのsp otなのかをイメージ分析を通して確認してあげます この際の二次元電気泳動はMembrane blotting 依頼とは別度にご注文をいただくことになり イメージ分析は無料です 必要なタンパク質量は 二枚のゲル (Membrane blotting 用, イメージ分析およびmass 分析用 ) に使える総 1mgくらいです GENOMINE その他の SERVICE SDS-PAGE gel 価格 : 44,900 (#S1010) タンパク質を確認するためのサイズマーカー価各が含まれた価格であり 希望する染色方法 ( CBB, SILVER) によって行います サービス当りサンプルは総 6 個以下になります Standard maker loading(1 sample) 価格 : 2,000 (#E1010) 二次元電気泳動時にマーカーを含めたい場合 追加するサービスです Spot picking(1 spot) 価格 : 2,000 (#E1020) 二次元電気泳動の後 希望する SPOT を PICKING してお送りするサービスです ( ただ 配送費は依頼者のご負担とな ります )
Service item cat # 1. Mass analysis Web 価格 ( 円 ) MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS M4010 21,600 MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS 96well format M4011 20,100 CAF MALDI sequencing M4012 38,300 LC-MS/MS MASS SPEC ANALYSIS M4013 73,600 MALDI TOF/ TOF(MS/MS) M4014 58,000 WHOLE PROTEIN MASS SPEC ANALYSIS M4015 21,600 MALDI-TOF MASS SPEC FOF MODIFICATION ANALYSIS M4016 43,200 2. 2DE GEL analysis SILVER STAINED 2-DE GEL D3010 59,300 COOMASSIE BLUE STAINED 2-DE GEL D3011 59,300 SILVER STAINED 2-DE GEL PLUS SPOT QUANTIFICATION D3012 71,600 SILVER STAINED 2-DE GEL PLUS EXPRESSION PATTERN CLASSIFICATION D3013 89,800 3. Phosphoprotein analysis Item1 with 1-D gel P8010 89,800 Item1 with 2-D gel P8011 98,800 Item2 - PMF によるリン酸化タンパク質の同定 P8020 21,600 Item3 - MALDI-TOF PSD によるリン酸化ペプチドの同定 P8030 31,000 Item4 - CAF sequencing によるリン酸化部位の決定 P8040 56,400 Item5 - リン酸化タンパク質の濃縮を含むサービス P8050 107,800 4. Membrane blotting Membrane blotting with 2-D gel (8cm IPG strip) B1010 111,920 Membrane blotting with 2-D gel (12cm IPG strip) B1011 115,920 Membrane blotting with 2-D gel (24cm IPG strip) B1012 119,920 5. 其他 SDS-PAGE gel S1010 44,900 Standard maker loading(1 sample) E1010 2,000 Spot picking(1 spot) E1020 2,000
FFoorr BBeetttteerr LLiiffee tthhrroouugghh wwwwww..ggeennoopprrootteeoomm..ccoomm Our service is responsive, Our scientists are accessible and Our approach focuses On the pursuit of excellence. Tel: +82-54-223-2463 Fax: +82-54-223-2460 Email: alloyo02@genomine.com Rm307 Venture Bldg, Pohang TechnoPark, Pohang, Kyungbuk, 790-834 Korea(ROK) 各サービスのサンプル準備および配送に関するご説明は http://www.bi-ga.com/pro/order.html もしくは http://genoproteom.com/ の サービスフロー をご参照ください 日本代理店株式会社リバネス (http://www.leaveanest.com/) TEL:03-6277-8041 FAX:03-6277-8042 担当 : 高橋宏之 (rs@leaveanest.com)