なぜ今 GLMM なのか 竹澤正哲 北海道大学 日本社会心理学会第 2 回春の方法論セミナー

Similar documents
(3) 検定統計量の有意確率にもとづく仮説の採否データから有意確率 (significant probability, p 値 ) を求め 有意水準と照合する 有意確率とは データの分析によって得られた統計値が偶然おこる確率のこと あらかじめ設定した有意確率より低い場合は 帰無仮説を棄却して対立仮説

スライド 1

異文化言語教育評価論 ⅠA 第 4 章分散分析 (3 グループ以上の平均を比較する ) 平成 26 年 5 月 14 日 報告者 :D.M. K.S. 4-1 分散分析とは 検定の多重性 t 検定 2 群の平均値を比較する場合の手法分散分析 3 群以上の平均を比較する場合の手法 t 検定

スライド 1

Microsoft PowerPoint - ch04j

Python-statistics5 Python で統計学を学ぶ (5) この内容は山田 杉澤 村井 (2008) R によるやさしい統計学 (

<4D F736F F D208EC08CB18C7689E68A E F AA957A82C682948C9F92E82E646F63>

Medical3

統計的データ解析

EBNと疫学

Medical3

Excelによる統計分析検定_知識編_小塚明_5_9章.indd

ビジネス統計 統計基礎とエクセル分析 正誤表

Microsoft PowerPoint - sc7.ppt [互換モード]

ANOVA

<4D F736F F D2090B695A8939D8C768A E F AA957A82C682948C9F92E8>

自動車感性評価学 1. 二項検定 内容 2 3. 質的データの解析方法 1 ( 名義尺度 ) 2.χ 2 検定 タイプ 1. 二項検定 官能検査における分類データの解析法 識別できるかを調べる 嗜好に差があるかを調べる 2 点比較法 2 点識別法 2 点嗜好法 3 点比較法 3 点識別法 3 点嗜好

Microsoft PowerPoint - 資料04 重回帰分析.ppt

当し 図 6. のように 2 分類 ( 疾患の有無 ) のデータを直線の代わりにシグモイド曲線 (S 字状曲線 ) で回帰する手法である ちなみに 直線で回帰する手法はコクラン アーミテージの傾向検定 疾患の確率 x : リスクファクター 図 6. ロジスティック曲線と回帰直線 疾患が発

日心TWS

kubostat7f p GLM! logistic regression as usual? N? GLM GLM doesn t work! GLM!! probabilit distribution binomial distribution : : β + β x i link functi

みっちりGLM

基礎統計

青焼 1章[15-52].indd

統計学 - 社会統計の基礎 - 正規分布 標準正規分布累積分布関数の逆関数 t 分布正規分布に従うサンプルの平均の信頼区間 担当 : 岸 康人 資料ページ :

情報工学概論


Probit , Mixed logit

RSS Higher Certificate in Statistics, Specimen A Module 3: Basic Statistical Methods Solutions Question 1 (i) 帰無仮説 : 200C と 250C において鉄鋼の破壊応力の母平均には違いはな

Microsoft PowerPoint - e-stat(OLS).pptx

PowerPoint プレゼンテーション

Microsoft Word - å“Ÿåłžå¸°173.docx

PowerPoint プレゼンテーション

Microsoft PowerPoint - GLMMexample_ver pptx

Excelにおける回帰分析(最小二乗法)の手順と出力

kubostat2017c p (c) Poisson regression, a generalized linear model (GLM) : :

経済統計分析1 イントロダクション

不偏推定量

Microsoft PowerPoint - statistics pptx

多変量解析 ~ 重回帰分析 ~ 2006 年 4 月 21 日 ( 金 ) 南慶典

Chapter カスタムテーブルの概要 カスタムテーブル Custom Tables は 複数の変数に基づいた多重クロス集計テーブルや スケール変数を用いた集計テーブルなど より複雑な集計表を自由に設計することができるIBM SPSS Statisticsのオプション製品です テーブ

異文化言語教育評価論 ⅠA 教育 心理系研究のためのデータ分析入門 第 3 章 t 検定 (2 変数間の平均の差を分析 ) 平成 26 年 5 月 7 日 報告者 :M.S. I.N. 3-1 統計的検定 統計的検定 : 設定した仮説にもとづいて集めた標本を確率論の観点から分析し 仮説検証を行うこと

,, Poisson 3 3. t t y,, y n Nµ, σ 2 y i µ + ɛ i ɛ i N0, σ 2 E[y i ] µ * i y i x i y i α + βx i + ɛ i ɛ i N0, σ 2, α, β *3 y i E[y i ] α + βx i

Microsoft PowerPoint - stat-2014-[9] pptx

Exploring the Art of Vocabulary Learning Strategies: A Closer Look at Japanese EFL University Students A Dissertation Submitted t

<4D F736F F F696E74202D A328CC B835E89F090CD89898F4B814096F689AA>

回帰分析の用途・実験計画法の意義・グラフィカルモデリングの活用 | 永田 靖教授(早稲田大学)

カイ二乗フィット検定、パラメータの誤差

橡ボーダーライン.PDF

Microsoft Word - 保健医療統計学112817完成版.docx

Microsoft PowerPoint - A1.ppt [互換モード]

<4D F736F F D204B208C5182CC94E497A682CC8DB782CC8C9F92E BD8F6494E48A722E646F6378>

kubostat2017b p.1 agenda I 2017 (b) probability distribution and maximum likelihood estimation :

様々なミクロ計量モデル†

JMP による 2 群間の比較 SAS Institute Japan 株式会社 JMP ジャパン事業部 2008 年 3 月 JMP で t 検定や Wilcoxon 検定はどのメニューで実行できるのか または検定を行う際の前提条件の評価 ( 正規性 等分散性 ) はどのメニューで実行できるのかと

はじめに Excel における計算式の入力方法の基礎 Excel では計算式を入力することで様々な計算を行うことができる 例えば はセルに =SQRT((4^2)/3+3*5-2) と入力することで算出される ( 答え ) どのような数式が使えるかは 数式

14 化学実験法 II( 吉村 ( 洋 mmol/l の半分だったから さんの測定値は くんの測定値の 4 倍の重みがあり 推定値 としては 0.68 mmol/l その標準偏差は mmol/l 程度ということになる 測定値を 特徴づけるパラメータ t を推定するこの手

Microsoft Word - Stattext13.doc

Microsoft PowerPoint - 統計科学研究所_R_重回帰分析_変数選択_2.ppt

NLMIXED プロシジャを用いた生存時間解析 伊藤要二アストラゼネカ株式会社臨床統計 プログラミング グループグルプ Survival analysis using PROC NLMIXED Yohji Itoh Clinical Statistics & Programming Group, A

日本製薬工業協会シンポジウム 生存時間解析の評価指標に関する最近の展開ー RMST (restricted mean survival time) を理解するー 2. RMST の定義と統計的推測 2018 年 6 月 13 日医薬品評価委員会データサイエンス部会タスクフォース 4 生存時間解析チー

相関分析・偏相関分析

統計学の基礎から学ぶ実験計画法ー1

第7章

Microsoft Word - Stattext12.doc

Microsoft PowerPoint - R-stat-intro_12.ppt [互換モード]

Microsoft Word - SPSS2007s5.doc

Chapter 1 Epidemiological Terminology

講義「○○○○」

<4D F736F F D208EC08CB18C7689E68A E F193F18D8095AA957A C C839395AA957A814590B38B4B95AA957A2E646F63>

<4D F736F F D208D A778D5A8A778F4B8E7793B CC A7795D2816A2E646F6378>

PowerPoint プレゼンテーション

タイトルを修正 軸ラベルを挿入グラフツール デザイン グラフ要素を追加 軸ラベル 第 1 横 ( 縦 ) 軸 凡例は削除 横軸は, 軸の目盛範囲の最小値 最 大値を手動で設定して調整 図 2 散布図の仕上げ見本 相関係数の計算 散布図を見ると, 因果関係はともかく, 人口と輸送量の間には相関関係があ

Microsoft PowerPoint - データ解析発表2用パワポ

3. みせかけの相関単位根系列が注目されるのは これを持つ変数同士の回帰には意味がないためだ 単位根系列で代表的なドリフト付きランダムウォークを発生させてそれを確かめてみよう yと xという変数名の系列をを作成する yt=0.5+yt-1+et xt=0.1+xt-1+et 初期値を y は 10

スライド 1

講義のーと : データ解析のための統計モデリング. 第5回

目次 1 章 SPSS の基礎 基本 はじめに 基本操作方法 章データの編集 はじめに 値ラベルの利用 計算結果に基づく新変数の作成 値のグループ化 値の昇順

経済統計分析1 イントロダクション

<4D F736F F F696E74202D B835E89F090CD89898F4B81408F6489F18B4195AA90CD A E707074>

Microsoft PowerPoint - S11_1 2010Econometrics [互換モード]

解析センターを知っていただく キャンペーン

ファイナンスのための数学基礎 第1回 オリエンテーション、ベクトル

SAS_2014_zhang_3

1.民営化

Microsoft Word - eviews6_

Microsoft PowerPoint - 測量学.ppt [互換モード]

データ科学2.pptx

Microsoft PowerPoint - H17-5時限(パターン認識).ppt

医学統計勉強会 第 6 回経時的繰り返し測定データの解析 医学統計勉強会 東北大学病院循環器内科 東北大学病院臨床研究推進センター共催東北大学大学院医学系研究科 EBM 開発学寄附講座宮田敏 Absence of evidence is not evidence of absence! - Carl

Microsoft PowerPoint - SAS2012_ZHANG_0629.ppt [互換モード]

kubostat2018a p.1 統計モデリング入門 2018 (a) The main language of this class is 生物多様性学特論 Japanese Sorry An overview: Statistical Modeling 観測されたパターンを説明する統計モデル

統計モデリング入門 2018 (a) 生物多様性学特論 An overview: Statistical Modeling 観測されたパターンを説明する統計モデル 久保拓弥 (北海道大 環境科学) 統計モデリング入門 2018a 1

森林水文 水資源学 2 2. 水文統計 豪雨があった時, 新聞やテレビのニュースで 50 年に一度の大雨だった などと報告されることがある. 今争点となっている川辺川ダムは,80 年に 1 回の洪水を想定して治水計画が立てられている. 畑地かんがいでは,10 年に 1 回の渇水を対象として計画が立て

Microsoft Word - reg2.doc

モジュール1のまとめ

<4D F736F F D208EC08CB18C7689E68A E F193F18D8095AA957A C C839395AA957A814590B38B4B95AA957A2E646F63>

今日の要点 あぶない 時系列データ解析は やめましょう! 統計モデル のあてはめ (危 1) 時系列データの GLM あてはめ (危 2) 時系列Yt 時系列 Xt 各時刻の個体数 気温 とか

スライド 1

角度統計配布_final.pptx

Transcription:

なぜ今 GLMM なのか 竹澤正哲 北海道大学 日本社会心理学会第 2 回春の方法論セミナー

院生時代 あるデータに出会った 条件 1 条件 2 条件 3 条件 4 実験者のカード 実験者のカード 実験者のカード 実験者のカード 自分のカード 自分のカード 自分のカード 自分のカード 交換する or 交換しない 交換する or 交換しない 交換する or 交換しない 交換する or 交換しない よし 条件は被験者内要因だから反復測定ロジスティック回帰をしよう

反復測定ロジスティック回帰??

SAS も SPSS も どこを探しても 反復測定ロジスティック回帰なんて見当たらない 大津起夫先生 ( 現大学入試センター ) 一般推定方程式モデル (Generalized Estimation Equation model) で分析すればいい SAS の proc genmod でできるから 後から分かったが これは GLMM の親戚だった ここから私と GLMM との出会いが始まる

Generalized Linear Mixed Model

2000 年代に生態学を中心として利用され始める 同時期 沓掛展之氏 ( 総研大 ) 久保拓弥氏 ( 北大 ) が相次いで インターネット上で情報を提供し始める Bolker et al. (2009). Generalized linear mixed model: A prac>cal guide for ecology and evolu>on. Trends in Ecology and Evolu2on. doi:10.1016/j.tree.2008.10.008 ü 個人的にオススメ 被引用回数は 2000 に迫る 久保拓弥 (2012) データ解析のための統計モデリング入門 岩波書店 現在 10 版を重ねる

何が凄いって 一般線形モデル ( 分散分析 + 重回帰分析 ) の場合 従属変数 : 連続変量 ( 正規分布 ) 独立変数 : カテゴリカル / 連続変量 GLMM 分散分析 重回帰分析 ロジスティック回帰 多項ロジット 対数線形モデル などが 1 つでできる 鍵となるのが 確率分布とリンク関数という 2 つの概念 この 2 つをオプションとして指定することで 多様なデータを 1 つのモデル内で分析できる

それぞれ無関係だと考えて来た人も多いのでは? 同一の参加者から繰り返しデータが測定されたら 反復測定分散分析 複数の集団が存在し 個人はその集団のどれかに所属していたら 階層線形モデル ( マルチレベルモデル ) 枝分かれ実験のように条件がネストしていたら 平均平方和と自由度をあれこれいじって は 反復測定? 変量効果 (random effects) というたった 1 つの概念で 全てを扱えることを知っていましたか?

変量効果 (Random Effects) 反復測定 = 被験者内要因 y ij = 個人 i の条件 j における反応 y ij = β 0 + β 1 x ij + r i + e ij 階層構造 ( ランダム切片 ) y ig = 集団 g に属する個人 i の反応 y ig = β 0 + β 1 x ig + r g + e ig 平均 0, 分散 σ の正規分布に従う

反復測定分散分析と混合モデル 一般線形モデル 一般線形混合モデル 単に混合モデルとも呼ばれることも 一般線形モデル + 反復測定 球面性 Greenhouse- Geisser などカッコイイ名前がたくさん登場 大量の裏紙の源泉 反復測定分散分析と 混合モデルは似ているが別物 反復測定分散分析よりも 混合モデルを使って反復測定のデータを分析するが多くのメリットがある Ø 井関龍太氏 ( 理研 ) のスライドが詳しい ü hop://www.slideshare.net/masarutokuoka/ss- 42957963

これまで私たちが様々な道具を使い分けて分析していたデータは GLMM ひとつで分析できてしまうことが 被験者内要因や集団 個人という階層データは 複数の道具を使い分けずとも 変量効果 ( 混合モデル ) という単一の概念で表現できることが けれど これまでのやり方で問題はなかったし 同じ分析ができるというだけなら 別に GLMM を学ぶ必要なんてないと思う

GLMM GLMM

1

MPIB 認知心理学者が ある認知能力を測定するために複数のからなる尺度を作成

参加者 A 1 2 3 4 参加者 B 1 2 3 4 参加者 C 1 2 3 4 参加者 A の平均値参加者 B の平均値参加者 C の平均値参加者毎に算出された平均値が ある基準値と比較して 有意に大きいことを検定し 人間は優れた / 正確な能力を持つ と結論づけた =by- par>cipant analysis 認知心理学者が行なった分析

MPIB 認知心理学者が ある認知能力を測定するために複数のからなる尺度を作成 これに対して 行動生態学者が噛み付いた その能力を測定する複数は の母集団からランダムにサンプリングされたものとみなし それを考慮して分析しなければならない

行動生態学者の指摘 大学生という母集団 参加者 A 参加者 B 参加者 C 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 の母集団 = ランダム サンプリング

MPIB 認知心理学者が ある認知能力を測定するために複数のからなる尺度を作成 これに対して 行動生態学者が噛み付いた その能力を測定する複数は の母集団からランダムにサンプリングされたものとみなし それを考慮して分析しなければならない だが ほとんどの心理学者はこの主張に反発した みんなこうやって分析しているのに なぜそんな複雑なことをやらなければならないのか

を変量効果として扱わないと... 標本平均 m μ 1 2 3 4 の母集団母平均 μ = 0 1. 標本平均は高確率で母平均よりわずかに大きく or 小さくなる 2. サンプリングされたに解答する参加者数が多くなるほど このわずかな差が有意になりやすくなる Type I error の増加

Murayama, Sakaki, Yan, & Smith (2014). Type I error inflafon in the tradifonal by- parfcipant analysis to metamomory accuracy: A generalized mixed- effects model perspecfve. JEL:LMC. doi: 10.1037/a0036914 より Figure 1 GAMMA AND MIXED MODELING 7 0.4 G Gw G* Pearson 0.3 0.2 0.1 cal Association or one of its allied publishers. idual user and is not to be disseminated broadly. 第一種 過誤 発生確率 Type 1 Error Rate 0.0 0.4 0.3 0.2 0.1 0.0 0.4 0.3 0.2 0.1 0.0 Figure 1. Point-biserial Polyserial Logistic Da Az Hart's D Mixed model z test Mixed model LRT 20 40 60 80 20 40 60 80 20 40 60 80 20 40 60 80 Number of Participants Number of Items 10 30 50 Type I error rates as a function of number of participants and number of items in Simulation 1, when 70

2 この後に続く 2 つのトークで繰り返し登場するポイントです

3

第 1 回春の方法論セミナーにおける 岡田謙介氏 ( 専修大 ) の指摘 統計学から 提言 日本社会心理学会春の方法論セミナーあなたの実験結果 再現できますか? false positive psychology の最前線 2014/3/17 型に まった 検定 と付随する枠組み 仮説検定における再現性の問題と新たな方法論 専修大学 オーダーメイド 仮説 モデル 積極的利用 岡田謙介 30 再現可能性問題の源泉のひとつは 心理学者が仮説検定パラダイムに依拠して研究を行い続けてきたことにある hop://www.socialpsychology.jp/sympo/seminar_140317/jssp_ss2014_okada.pdf

仮説検定から統計モデリングへのパラダイム転換 仮説検定パラダイム 帰無仮説を設定し p 値に基いて棄却するか否かを決定 現象 = 効果がある / ない という二分的な認識へと研究者を導いてしまう 検定力分析も停止規則も 結局は 従来のパライダムの中に留まった議論に過ぎない 統計モデリングパラダイム 複数のモデル ( 仮説 ) を立て ある基準に照らして その中で最も良いモデルを選ぶ 最も良いモデルが見つかったとしても 研究者が考えつくことのできなかった別のモデル ( 仮説 ) が存在し そちらの方がより良いモデルである可能性が常に存在している

統計モデリングと現代科学 t 検定や分散分析の積み重ねを通じて 精緻な議論を積み上げていくことは 心理学における王道 方法論上のドグマであると言えるかもしれない その礎たる仮説検定パラダイムを捨て去る必要はまだないだろう だが現代科学においては 統計モデリングの発想が浸透し これまでに見たことがない ブレークスルーを着実に生み出している 久保氏による緑本は 統計モデリングという考え方を 我々が慣れ親しんだ題材を扱いながら学ぶ格好の書である

この後の流れ 久保拓弥 ( 北海道大学 ) GLMM の紹介 = 統計モデリングというマインドの紹介 緑本を一人で読み通すのは 骨が折れるかもしれない このトークの概要を理解した後でぜひチャレンジしていただきたい 清水裕士 ( 広島大学 ) 社会心理と GLMM の関係 これまで我々が用いて来た道具との 社会心理学者が扱うデータを例として GLMM を紹介する