Chapter 1 Epidemiological Terminology

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当し 図 6. のように 2 分類 ( 疾患の有無 ) のデータを直線の代わりにシグモイド曲線 (S 字状曲線 ) で回帰する手法である ちなみに 直線で回帰する手法はコクラン アーミテージの傾向検定 疾患の確率 x : リスクファクター 図 6. ロジスティック曲線と回帰直線 疾患が発

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8 A B B B B B B B B B 175

多変量解析 ~ 重回帰分析 ~ 2006 年 4 月 21 日 ( 金 ) 南慶典

1. 多変量解析の基本的な概念 1. 多変量解析の基本的な概念 1.1 多変量解析の目的 人間のデータは多変量データが多いので多変量解析が有用 特性概括評価特性概括評価 症 例 主 治 医 の 主 観 症 例 主 治 医 の 主 観 単変量解析 客観的規準のある要約多変量解析 要約値 客観的規準のな

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日本製薬工業協会シンポジウム 生存時間解析の評価指標に関する最近の展開ー RMST (restricted mean survival time) を理解するー 2. RMST の定義と統計的推測 2018 年 6 月 13 日医薬品評価委員会データサイエンス部会タスクフォース 4 生存時間解析チー

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こんにちは由美子です

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分析のステップ Step 1: Y( 目的変数 ) に対する値の順序を確認 Step 2: モデルのあてはめ を実行 適切なモデルの指定 Step 3: オプションを指定し オッズ比とその信頼区間を表示 以下 このステップに沿って JMP の操作をご説明します Step 1: Y( 目的変数 ) の

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本日の内容 相関関係散布図 相関係数偏相関係数順位相関係数 単回帰分析 対数目盛 2

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重回帰式 y= x x 2 重症度 5 TC TC 重症度

本書の内容 ( サンプルのため p18 まで ) はじめに p3 第 1 章 :R とパッケージのインストール p5 1.1 R のインストール p5 1.2 R の起動とパッケージのインストール p8 第 2 章 :R コマンダーの起動 終了 再起動 p12 第 3 章 : 外部 ( エクセル )

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タイトルを修正 軸ラベルを挿入グラフツール デザイン グラフ要素を追加 軸ラベル 第 1 横 ( 縦 ) 軸 凡例は削除 横軸は, 軸の目盛範囲の最小値 最 大値を手動で設定して調整 図 2 散布図の仕上げ見本 相関係数の計算 散布図を見ると, 因果関係はともかく, 人口と輸送量の間には相関関係があ

(3) 検定統計量の有意確率にもとづく仮説の採否データから有意確率 (significant probability, p 値 ) を求め 有意水準と照合する 有意確率とは データの分析によって得られた統計値が偶然おこる確率のこと あらかじめ設定した有意確率より低い場合は 帰無仮説を棄却して対立仮説

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13章 回帰分析

日本言語科学会(JSLS)チュートリアル講演会 平成13年12月16日(日)午前10時30分から午後4時30分 慶應義塾大学三田キャンパス東館6階G-SEC Lab   言語研究のための統計解析 「論理」学としての思考法,「美」学としての提示法

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回帰分析の重要な手続きは 次の 3 点にまとめられる 順に説明しよう ( 1) もっともよい線を引く ( 2) その線はどのくらいよい線であるかを評価する ( 3) 母集団についても同様の線を引く価値があるかどうかを判断する 概要をスライドで確認 テキスト p.99 の図が回帰分析の本質 実際のデー

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50% であり (iii) 明らかな心臓弁膜症や収縮性心膜炎を認めない (ESC 2012 ガイドライン ) とする HFrEF は (i)framingham 診断基準を満たす心不全症状や検査所見があり (ii) は EF<50% とした 対象は亀田総合病院に 年までに初回発症

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こんにちは由美子です

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0 部分的最小二乗回帰 Partial Least Squares Regression PLS 明治大学理 学部応用化学科 データ化学 学研究室 弘昌

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異文化言語教育評価論 ⅠA 第 4 章分散分析 (3 グループ以上の平均を比較する ) 平成 26 年 5 月 14 日 報告者 :D.M. K.S. 4-1 分散分析とは 検定の多重性 t 検定 2 群の平均値を比較する場合の手法分散分析 3 群以上の平均を比較する場合の手法 t 検定

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Dependent Variable: LOG(GDP00/(E*HOUR)) Date: 02/27/06 Time: 16:39 Sample (adjusted): 1994Q1 2005Q3 Included observations: 47 after adjustments C -1.5

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目次 1 章 SPSS の基礎 基本 はじめに 基本操作方法 章データの編集 はじめに 値ラベルの利用 計算結果に基づく新変数の作成 値のグループ化 値の昇順

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因子分析

一般化線型モデルとは? R 従属変数群が独立変数群の一次結合と誤差で表されるという形のモデルを線型モデルという ( 回帰分析はデータへの線型モデルの当てはめである ) 式で書けば Y = β 0 + βx + ε R では glm( ) という関数で実行する glm( ) は量的なデータが正規分布に

k3 ( :07 ) 2 (A) k = 1 (B) k = 7 y x x 1 (k2)?? x y (A) GLM (k

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回帰分析 重回帰(1)

Statistical Solutions 社の沿革 1984 BMDP Statistical Software Inc. がCorkに欧州本部を設立 専門のマネージメントチームを結成売上高が急速に成長製品開発チームを編成 1995/6 CEOのMary ByrneがMBO(M

Transcription:

Appendix Real examples of statistical analysis 検定 偶然を超えた差なら有意差という P<0.05 なら統計学的有意というデータ型 比較型で検定手法は異なる Chi-square test ( カイ二乗検定 ) Medical Tribune. 2018-1-28. 2 1 2 Chi-square test ( カイ二乗検定 ) Medical Tribune. 2018-3-1. 3 4 3 Unpaired t-test( 対応のない t 検定 ) Wilcoxon test( ノンパラメトリック ) Medical Tribune. 2017-12-07. 4 Paired t-test( 対応のある t 検定 ) Paired t-test( 対応のある t 検定 ) Wilcoxon test( ノンパラメトリック ) 5 Medical Tribune. 2017-12-07. 6 5 6 1

相関分析 (Correlation analysis) ANOVA( 分散分析 ) ANOVA( 分散分析 ) 7 Medical Tribune. 2018-1-21. 8 7 8 虐待の相談件数は年々増えている 心理的虐待は特に増え方が著しい 年間 14 万件の相談件数がある 相談しない例は その倍以上はあるだろう ( 実態はもっと!) 1 万件以上 / 月 都道府県辺り 約 500 件 / 月の相談件数 気づく点をあげなさい 調べたいことをあげなさい どういった分析をしますか? 追加データは必要か? 子供は毎年 100 万人出生 10 年 ~1,000 万人 100 人に一人が虐待? 同じ人が何回も虐待相談しているので 過大評価? 10 歳以上の人も虐待対象なので 過大評価? 9 10 気づく点をあげなさい 調べたいことをあげなさい どういった分析をしますか? 追加データは必要か? 子育て 教育無償化への関心は子育て世代で高い Why? 当事者は関心が高い 40 歳以上ではそんなに関心度は変わらない Why? 当事者でなければ同じ 優先度 5~7 位なのに どうして関心度 50% 程度と高いか? 40 歳以上では ( 歳を取ると ) 何事へも関心度が高くなる 11 12 2

X と Y の関係 単変量解析 多変量解析 モデル解析 Multivariate Analysis 多変量解析 説明変数原因変数独立変数 X Z 影響変数撹乱変数交絡変数 Y 目的変数結果変数従属変数 13 14 用 途 回帰モデル 交絡変数の影響を除去して 因果関係を正しく検討したい ある人の目的変数値を予測したい 他のリスクファクターの寄与度を見たい どれが真に独立な影響因子かを見極めたい 回帰モデル ( 回帰式とも言う ) Y = b 0 + b 1 LDL + b 2 Obesity パラメタ ( 回帰係数とも言う ) b 0,, b 1, b 2 Y によって名称が変わる Y が連続量 重回帰 (Multiple regression) Y がイベント ( 二値 ) の有無 ロジスティック回帰 (Logistic regression) Y がイベント発現までの時間 コックス回帰 (Cox regression) 15 16 重回帰分析 結果の読み方 結果変数 ( y ) 体重減少 (kg) 説明変数 ( x ) ジョギング 交絡変数 ( z ) 年齢 性別 飲酒量 モデル式 y=a +b 1 x 1 +c 1 z 1 +c 2 z 2 < 直線関係が前提 > 目的変数は体重減少 (kg) 説明変数 単位 推定値 P 値 ジョギング 実施 5kg 0.03 年齢 10 歳 -2kg 0.53 性別 女性 2kg 0.30 飲酒量 ビール1 本 -3kg 0.09 17 18 3

適当なモデルかのチェック Logistic regression ロジスティック回帰 モデルへの適合度 残差 Residual Lack of fit analysis 決定係数 ( 説明割合 ) Adjusted R 2 for the number of variables in the model 影響度の分析 てこ比 Leverage Isolated point であり 回帰係数にすごく影響するデータ 影響度 Influence 各回帰係数の推定値に影響するデータ 交互作用項を入れたら 必ず主効果も含むこと 目的変数 (y 変数 )= 二値データ心筋梗塞の有無 骨折の有無 などその危険因子を, 多変量的に探るその将来予測をする 定式化 P = Pr (D+) は, 疾病確率 x 1,, x k は, 説明 ( リスク ) 変数 ln P 1 P = a + b 1x 1 + + b k x k P = exp(a + b 1x 1+... +b kx k) 1 + exp(a + b 1x 1+... +b kx k) 19 20 Logistic Regressionでの相対リスク (Relative Risk, RR) リスク比 (Risk Ratio, RR) 相対リスク (Relative Risk) RR = Risk in exposed group / Risk in unexposed group = aτ a+b cτ c+d オッズ比 (Odds Ratio, OR) 相対オッズ (Relative Odds) OR = Odds in exposed group / Odds in unexposed group = aτ b cτ d ~ RR (if a, c~0) Disease Normal Exposed a b Unexposed c d ロジスティック回帰 Logistic regression ln P 1 P = a + b 1x 1 + + b k x k P = exp(a + b 1x 1+... +b kx k) 1 + exp(a + b 1x 1+... +b kx k) OR = exp (b i ) x 1 1 単位当たりのオッズ比 21 22 交互作用を含むモデルの有用性 Survival analysis Survival analysis 生存時間解析 ロジスティック回帰 (Logistic regression) 目的変数妊娠高血圧腎症早産説明変数プロバイオティクス摂取 23 Outcome アウトカム Time to event data Point Censoring 打ち切り [ + データ ] Methods Kaplan-Meier plot カプラン マイヤープロット Log-rank test ログランク検定 Cox proportional hazards model Cox 比例ハザードモデル 23 24 4

ロジスティック回帰との違い 評価項目が 骨折 の場合 Logistic 骨折の有無 Survival 骨折までの期間 違い Logistic イベントの有無 オッズ比 (~ リスク比, in a rare event) Survival 速さ ( 早く起こると危険 ) ハザード比 腎臓進行がんの RCT 縦軸 : 無増悪生存率 Survival Analysis 生存率解析 Kaplan-Meier Curve カプラン マイヤー曲線 Progression-free survival (PFS) 無増悪生存率 Median Survival Time (MST) 生存期間中央値 Log-rank test ログランク検定 Hazard Ratio (HR) ハザード比 Relative Risk の 1 つ時間概念が入る 25 26 比例ハザード性を満たす 比例ハザード性を満たさない 15% リスク低下 生存時間解析 Survival analysis 累積発生率 Kaplan-Meier plot 群間比較 Log-rank test ハザード比 Hazard ratio Medical Tribune. 2017-4-06. 28 27 28 5