Saito R.
|
|
|
- さみら とみもと
- 7 years ago
- Views:
Transcription
1
2 Saito R.
3
![1 [1, 2] 1950 microorganism 10µm 1µm Escherichia coli bacteria 1 1: 17 ( 1)](/docs-images/41/22784409/images/4-0.png "(Gene) 1933 4 3 19 1865 ( 2) 2: (1822-1884) [3] 1900 DNA deoxyribonucleic acid 1")
4 1 [1, 2] 1950 microorganism 10µm 1µm Escherichia coli bacteria 1 1: 17 ( 1) (Gene) ( 2) 2: ( ) [3] 1900 DNA deoxyribonucleic acid 1 ( ) 1-4
5 1928 Streptococcus pneumoniae DNA DNA 1953 ( 3) DNA 1. DNA (A) (G) (C) (T) 4 (4 ) 2. (A T C G) DNA DNA mrna (, central dogma) ( : DNA promoter
6 1: 2 70% (H 2 O) 1 20 ( 7) (6 ) 4 3 DNA mrna RNA: ribonucleic acid RNA mrna (central dogma) 3-6
7 DNA RNA mrna ( ) mrna RNA DNA (mrna ) ( ) 4: 3 5 RNA 4 2 DNA RNA DNA DNA (A: adenine) (G: guanine) (C: cytosine) (T: thymine) 4 (DNA ) ( 6) RNA 3 mrna( RNA: messenger) trna( RNA: transfer) rrna( RNA: ribosome) 2 RNA (U: 2 srna mirna RNA [4] 4-7
8 laci lacz ( ) ( ) 水 素 結 合 5: Lac NH 2 リン 酸 基 塩 基 NH 2 N - O O P O O - CH 2 O N N O 2.0 nm -O O P O - O CH 2 O N O - O O P O O - NH 2 N 3.4 nm OH OH 糖 CH 2 O N O ヌクレオチド OH 6: DNA P: S: A: G: C: T: 4-8
9 uracyl) 4 (RNA ) DNA (base pair) DNA base (b) base pair (bp) (-COOH) (NH2-) 4 1. Ara, Val, Leu, Ile, Met, Trp, Phe, Pro 2. Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asp, Gln 3. Lys, His, Arg 4. Asp, Glu α- β ( 8) 8: [5]
10 gly G Glycine ala A Alanine arg R Arginine asn N Asparagine asp D Aspartic acid cys C Cysteine gln Q Glutamine glu E Glutamic acid his H Histidine ile I Isoleucine leu L leucine lys lysine met M Methionine phe F Phenylalanine pro P Proline ser S Serine thr T Threonine trp W Tryptophan tyr Y Tyrosine val V Valine 7:
11 転 写 開 始 点 コード 領 域 プロモーター aactataatgaaccaactgcttac ctggagatgaatatgagctatacc gcgaaaaaataatcatttg ttgatattacttggttgacgaatg gacctctacttatactcgatatgg cgcttttttattagtaaac 転 写 開 始 コドン 終 止 コドン Caacugcuuac cuggagaugaauaugagcuauacc gcgaaaaaauaaucauuug 翻 訳 M S Y T アミノ 酸 配 列 A DNA mrna タンパク 質 9: DNA ( ) soda soda DNA 2 DNA mrna mrna genetic code 2 9 AUG (M) AGC (S) 2 3 DNA DNA 7 7 4,000 4,000,000 DNA 30, ,000 3,000,000,000 DNA 5 100,
12 UC A G U C A G 終 止 Trp 終 止 UUU Phe F UCU Ser S UAU Tyr Y UGU Cys C UUC Phe F UCC Ser S UAC Tyr Y UGC Cys C UUA Leu L UCA Ser S UAA Ochre UGA Opal UUG Leu L UCG Ser S UAG Amber TrpW CUU Leu L CCU Pro P CAU His H CGU Arg R CUC Leu L CCC Pro P CAC His H CGC Arg R CUA Leu L CCA Pro P CAA Gln Q CGA Arg R CUG Leu L CCG Pro P CAG Gln Q CGG Arg R AUU Ile I ACU Thr T AAU Asn N AGU Ser S AUC Ile I ACC Thr T AAC Asn N AGC Ser S AUA Ile I ACA Thr T AAA Lys AGA Arg R AUG Met M ACG Thr T AAG Lys AGG Arg R GUU Val V GCU Ala A GAU Asp D GGU Gly G GUC Val V GCC Ala A GAC Asp D GGC Gly G GUA Val V GCA Ala A GAA Glu E GGA Gly G GUG Val V GCG Ala A GAG Glu E GGG Gly G 2: 止 UGGTrp 1 3 mrna T U 7-12
13 genome: gene chromosome ( 10) 1995 TIGR The Institute for Genomic Research Mycoplasma genitalium 1,000 [6] [7, 8] ( 11) bioinformatics [9] 10: (homology search) ( 12) BLAST [10, 11] (10 ) [12]
![genitalium 1,000 [6] [7, 8] ( 11) bioinformatics](/docs-images/41/22784409/images/page_13.jpg "[9] 10: (homology search) ( 12) BLAST [10, 11]")
14 塩 基 数 90,000,000,000 80,000,000,000 70,000,000,000 60,000,000,000 50,000,000,000 40,000,000,000 30,000,000,000 20,000,000,000 10,000,000,000 塩 基 数 エントリー 数 エントリー 数 90,000,000 80,000,000 70,000,000 60,000,000 50,000,000 40,000,000 30,000,000 20,000,000 10,000, 年 (12 月 ) 11: GenBank in vitro 13: 100 ( 13) 8-14
15 ヒットした 配 列 #1 入 力 配 列 類 似 部 分 データベースに 登 録 があった 類 似 配 列 >ref NP_ FOS-like antigen 2 [Gallus gallus] Length=323 配 列 情 報 配 列 類 似 性 に 関 する 情 報 Score = 143 bits (361), Expect = 3e-32 Identities = 115/252 (45%), Positives = 155/252 (61%), Gaps = 21/252 (8%) Frame = +1 Query 133 GSFLFTAACGTGNSPHLCPEPARSRRLSPSVLF*DFCTDLAVSSANFIPTVTAISTSPDL 312 GSF ++ +G+ H PEP + F D+ S + FIPT+ AI+TS DL Sbjct 7 GSFDTSSRGSSGSPGH--PEPYSAGAAQQ-----FRVDMPGSGSAFIPTINAITTSQDL 59 Query 313 QWLVQPALVSSVAPSQTRAPHPFGVPAPSAG------AYSRAGVVTMTGGRAQSIGRRG 474 QW+VQP +++S++ +R+ HP+ P P A R GV+T+ ++GRR Sbjct 60 QWMVQPTVITSMSSPYSRS-HPYSHPLPPLSSVAGHTALQRPGVITI----GTTVGRRR 114 Query 475 VEQLSPeeeekrrirrerNMAAACRNRRRELTDTLQAETDQLEDESALQTEIANll EQLSPEEEERRIRRERN+AAACRNRRRELT+ LQAET+ LE+ES LQ EIA L Sbjct 115 RDEQLSPEEEERRIRRERNLAAACRNRRRELTELQAETEVLEEESVLQEIAELQ 174 Query 655 kekeklefilaahrpaci-pddlgfpeemsvasl--dltgglpevatpeseeaftlpll 825 EELEF+L AH P CI P++ P S+ S+ +G + P EE + L+ Sbjct 175 EELEFMLVAHSPVCISPEERRSPPTSSLQSVRTGASGAVVVQEPVEEEIPSSSLV 234 Query 826 NDPEPPSVEPV 861 D + ++P+ Sbjct 235 LDAQRSVIPI 246 ヒットした 配 列 #2 >gb AAS proto-oncogene protein c-fos [Phodopus roborowski] Length=108 Score = 142 bits (357), Expect = 9e-32 Identities = 84/89 (94%), Positives = 84/89 (94%), Gaps = 1/89 (1%) Frame = +1 Query 913 FPASSRPSGSET-ARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSGSLGMGPMATELEPLctpvvtctp 1089 F ASSRPSGSET ARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHS SLGMGPMATELEPLCTPVVTCTP Sbjct 1 FSASSRPSGSETTARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPMATELEPLCTPVVTCTP 60 Query 1090 sctaytssfvftypeadsfpscaaahrg 1176 SCT YTSSFVFTYPE DSFPSCAAAHRG Sbjct 61 SCTTYTSSFVFTYPETDSFPSCAAAHRG 89 12: FOS 8-15
16 (7 ) 2 1 DNA F F F F 1973 DNA ( 12 ) 9 DNA PCR 6 DNA 7 [13, 14] X 6 (Polymerase Chain Reaction) DNA
![7 [13, 14] 19 20 X 6](/docs-images/41/22784409/images/page_16.jpg "(Polymerase Chain Reaction)")
17 溶 液 中 の 様 々な 物 質 が 一 定 の 方 向 へ 移 動 ピーク 物 質 の 性 質 の 違 いによって 物 質 が 分 かれ ピークの 面 積 からそれぞれの 物 質 の 濃 度 が 得 られる 14: ( ) ( ) 9-17
18 l s x l,s, y l,s y l,s = L l S s x l,s (1) L l S s l s ˆl, ŝ l s 1 xˆl,s / yˆl,s = x l,s / y l,s = S ŝ (2) xˆl,ŝ yˆl,ŝ x l,ŝ y l,ŝ S s (xˆl,s ) (xˆl,ŝ ) (yˆl,s, yˆl,ŝ ) x l,ŝ (y l,s, y l,ŝ ) 2 x l,s [15] ( ) 14( ) [16] 8 9 (m/z) 10-18
19 15: expanda (edge) 10 [17] 10 (Systems biology)
20 8. AATF 9. Asn-syn Oxaloacetate Aspartate Asparagine I III Glutamate α G NH 3 ATP PPi AMP ATP 1. A I,II,III ADP NAD 2. ASD 3. HDH 4. HS 5. TS + NADH+H+ Aspartyl-P ASA Homoserine Homoserine-P Threonine 7. TDH Pi NADPH+H + NADP+ NADPH+H + NADP + ATP ADP H 2O Pi 10. Lys-syn 12. Met-syn NH 3 6. TDA Aminacetone Lysine Methionine Isoleucine 11. Lys-degr 16: [20] RNA ) [18] 2000 Curagen [19] RNA 11 ( 15)[25, 26] ATP CE-MS 12 ( 17) [13] (-ome) (Genome) (Gene) 3 11 RNA
21 17: CE-MS( - )( ) ( ) Genome DNA cdna Transcriptome CAGE RNA-Seq MALDI-TOFMS Proteome LC-MS Protein Chip CE-MS LC-MS Metabolome GC-MS 3: 10-21
22 dasp = V1 dt daspp = V1 V dt dasa = V2 V3 dt dhs = V3 V4 dt dhsp = V4 V5 dt dthr = V5 dt dnadph = dt 2 ( V + V ) 2 3 V = 1 V = V V V = 5 ( ) Vm 11 ASP Vm 13 ASP + V 2 m ASP + 11 L ASP L ASPP NADPH ASA Vm2F Vm 2B 2ASPP 2NADPH 2ASA ASPP NADPH ASA ASPP 2NADPH 2ASA ASA NADPH HS Vm3F Vm3B 3ASA 3NADPH 3HS ASA NADPH HS ASA 3NADPH 3HS Vm 4F HS V B L T + 1 HS + + 4HS 1 4L 4T Vm5.HSP 1 HSP + 5HSP T + 1 5T 1B ASPP NADP = = 2NADP 3NADP NADP 3NADP 2NADP NADP NADP.HSP 18: ( 19) 1996 E-CELL ( 20)[21, 22, 23] (7 ) 480 (7 )
23 denom 2] 1][ [ 2] 1][ [ ] [ = eq er ef P P S S E v iq ms er eq ef is eq mp ef er eq mp ef eq mp ef ms er ms er P S P P P S S S P P S S 2] 2][ [ 2] 1][ [ 1] 1][ [ 2] 1][ [ 2] [ 1] [ 2] [ 1] [ denom = 3-ketoacyl-CoA thiolase Acyl-CoA dehydrogenase Enoyl-CoA hydratase 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (X)anoyl-CoA ETF(ox) 3-Oxo(X)anoyl-CoA NADH NAD+ -hydroxy(x)anoyl-coa trans-(x)-2-enoyl-coa ETF(red) substance /CELL/CYTOPLASM/ATP ATP 12000; substance /CELL/CYTOPLASM/ADP ADP 14000; reactor t t = t = 19: (wet) 11-23
24
25 20: E-CELL 11-25
26 グルコース 排 出 脂 肪 酸 グリセロール 解 糖 系 ATP 乳 酸 リン 脂 質 二 重 膜 の 生 成 脂 質 生 合 成 系 リン 脂 質 ATP 127 遺 伝 子 タンパク 質 分 解 転 写 機 構 ATP mrna trna rrna 翻 訳 機 構 21: TIGR Claig Venter ATP RNA ATP trna 2 rrna RNA E-CELL 13 mrna
27 22: E-Cell 3D ( ) ATP ATP E-CELL 2005 [24] E-CELL E-Cell 2010 (GUI) E-Cell IDE 11-27
28 (a) (b) (c) ゲノム プラスミド 23: (a) ( ) DNA ( DNA ) (b) PCR (c) 3 ( 22)[27] 12 8 DNA ( ) ( ) (transformation) ( 23) ( ) DNA 24 DNA DNA DNA DNA (ES ) 12-28
29 DNA mrna タンパク 質 遺 伝 子 変 異 転 写 翻 訳 タンパク 質 の 変 異 24: DNA DNA ( ) 1 (a) (b) (c) (d) c <200 <10 <500 25: (a) (b) DNA (c) (d) ( 1 kbp, 1,000 ) [30]
30 [28] Venter ( 25)[29, 30]
31 1. (central dogma) (a) DNA RNA (b) mrna 2. thr catccatgaaacgcatt...ggtgcgggctgacgcgt 9 (a) DNA (b) DNA DNA
32 [1] Alberts B et al. Molecular Biology of the Cell (4th edition) Garland Pub (2002/03) [2] Alberts B et al., Essential ( 2 ) (2005/09) [3] G., Gordon Edlin( ),,,,,, ( ) (1992/04) [4] ( ) Non-coding RNA (2006/04) [5] Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (2005) Pyrrolysine and selenocysteine use dissimilar decoding strategies. J Biol Chem. 280(21): [6] Fraser CM et al.(1995) The minimal gene complement of Mycoplasma genitalium. Science 270(5235): [7] Lander ES et al.(2001) Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. 409(6822): [8] Venter JC et al.(2001) The sequence of the human genome. Science. 291(5507): [9] ( ) ( ) (2005/07) [10] Altschul SF et al.(1990) Basic local alignment search tool. J Mol Biol 215(3): [11] ent WJ.(2002) BLAT the BLAST-like alignment tool. Genome Res. 12(4): [12] Arakawa, Mori, Ikeda, Matsuzaki T, obayashi Y, Tomita M(2003) G-language Genome Analysis Environment: a workbench for nucleotide sequence data mining. Bioinformatics 19(2): [13] ( ) (2003/11) [14] (2009/4) [15] (2001/03) [16] (2001/10) [17] Ishii N, Nakahigashi, Baba T, Robert M, Soga T, anai A, Hirasawa T, Naba M, Hirai, Hoque A, Ho PY, akazu Y, Sugawara, Igarashi S, Harada S, Masuda T, Sugiyama N, Togashi T, Hasegawa M, Takai Y, Yugi, Arakawa, Iwata N, Toya Y, Nakayama Y, Nishioka T, Shimizu, Mori H, Tomita M(2007) Multiple High-Throughput Analyses Monitor the Response of E. coli to Perturbations Science 316(5824):593-7
33 [18] DeRisi JL, Iyer VR, Brown PO.(1997) Exploring the metabolic and genetic control of gene expression on a genomic scale. Science 278(5338): [19] Uetz P et al.(2000) A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature 403(6770): [20] Raïs B, Chassagnole C, Mazat JP.(1995) Control of threonine pathway in E. coli. Application to biotechnologies. Acta Biotheor. 43(4): [21] Tomita M, Hashimoto, Takahashi, Shimizu TS, Matsuzaki Y, Miyoshi F, Saito, Tanida S, Yugi, Venter JC, Hutchison CA 3rd.(1999) E-CELL: software environment for whole-cell simulation. Bioinformatics 15(1): [22] Takahashi, aizu, Hu B, Tomita M(2004) A multi-algorithm, multi-timescale method for cell simulation. Bioinformatics. 20(4): [23] ( ) (2000/10) [24] Nakayama Y, inoshita A, Tomita M.(2005) Dynamic simulation of red blood cell metabolism and its application to the analysis of a pathological condition. Theor Biol Med Model 2(1):18. [25] Negishi Y., Nakamura H., Yachie N., Saito R., Tomita M. (2007) expanda: an integrated platform for network analysis and visualization. In Silico Biology 7, [26] Shannon P, Markiel A, Ozier O, Baliga NS, Wang JT, Ramage D, Amin N, Schwikowski B, Ideker T.(2003) Cytoscape: a software environment for integrated models of biomolecular interaction networks. Genome Res (11): [27] Arakawa, Yachie N, Tomita M.(2007) E-Cell Simulation Environment 3D: 3-dimensional visualization of cellular simulation results. ISMB [28] Itaya M, Tsuge, oizumi M, Fujita.(2005) Combining two genomes in one cell: stable cloning of the Synechocystis PCC6803 genome in the Bacillus subtilis 168 genome. Proc Natl Acad Sci U S A. 102(44): [29] Gibson DG et al.(2010) Creation of a bacterial cell controlled by a chemically synthesized genome. Science 329(5987):52-6 [30] (2010) 80(7):
34 DNA, 1-4, 4-7 mrna, 3-6 RNA, 4-7, 3-6, 6-9, 7-11, 1-4, 2-5, 4-7, 12-28, 2-5, 3-6, 4-7, 3-6, 9-16, 12-28, 2-5, 4-7, 1-4, 9-16, 3-6, 10-20, 11-22, 1-4, 9-16, 12-28, 8-13, 10-20, 3-6, 7-11, 7-11, 10-19, 11-22, 9-16, 2-5, 3-6, 8-13, 10-20, 1-4, 3-6, 6-9, 2-5, 3-6, 3-6, 4-7, 10-18, 8-13
35 Committee Molecular Biology Ohashi Y. Simulation ikuchi S., Saito R. Remaining Parts Saito R.(Editor), Ito T., Saito N. Manuscript Proofreading Ishii N., Sato A., Tsuge., Masuda T., Otomo., ochiwa H., Otani N., uroki A., Tomita M. Special thanks to Prof. Itaya M. & Dr. Takahashi. SBC SBC SSC BFG
Perl + α. : DNA, mrna,,
2009 Perl + α. : DNA, mrna,, DNA .. DNA A C G T DNA 2 A-T, C-G DNA NH 2 NH 2 O - O O N P O - O CH 2 O N N O - O P O CH 2 O N O - O O P O NH 2 O - O - N CH 2 O N O OH OH OH DNA or RNA (U) (A) (G) (C)
遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景
自己組織化マップ Self-Organization Map (SOM) 自己組織化マップとは? K 平均アルゴリズムは あらかじめクラスター数 K を設定し 互いに近い値を持った各要素が同一クラスターに所属するように所属クラスターを決めてゆく 自己組織化マップは互いに近い値を持った各要素が近くなるように低い次元上にマップする 自己組織化マップは 1988 年に Kohonen が提案した (Kohonen
untitled
1 1 2 CADLIVE E-CELL 3 GEM CE/MS MGF WT MGF 4 2 WT E-Cell MASK 5 CE-MS, CE- TOFMS LC-MS 24, 5 9 2 0 6 3 CE-MS CE MS Soga, T. et al. (2002) Anal Chem. 74, 2233-2239 7 CE-MS 859 452, 269, 86 8 4 LC-MS 9
表紙／１５１７０８Ｈ
! " # $ % & ' ( ) ! #! $! " % & " ' " # * + $ %, &! & ', '! " # $ (! " # $ )! " # $ !!$ "! " # $ #! " # $ $! " # $ %! " # $ ! " # " 1 $ 2 " $ % 3 & % ' ( 4 ( ) * ' + 5, -. 6 / 0 0 +, 1 -. 2 3 /! /!%!!
1_alignment.ppt
" " " " n " n n " n " n n n " n n n n " n LGPSSKQTGKGW-SRIWDN! + +! LN-ITKSAGKGAIMRLGDA! " n -------TGKG--------!! -------AGKG--------! " n w w w " n w w " " " 11 12 " n w w w " n w w A! M! O! A!
ウェブ23Brev2
23B 23B.1 23B.1.1 23B.1.2 23B.2 23B.2.1 23B.2.2 a b 23B.3 23B.3.1 23B.3.2 23B.4 23B.4.1 23B.4.2 23B.4.3 23B.5 23B.5.1 23B.5.2 23B.6 23B.6.1 a b c Edman d e 23B.6.2 23B.6.3 23B.7 23B.7.1 a b c 23B.7.2 23B.7.3
p.1127 Chapter 22 Amino Acids, Peptides, and Proteins p.1128 p.1128 Amino acid Peptide Amino acid p.1132 p.1128 p.1129 p.1129 p.1129 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130 p.1130
2
2 3 4 TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT
スライド 1
タンパク質 ( 生化学 1) 平成 29 年 4 月 20 日病態生化学分野 分子酵素化学分野教授 山縣和也 生化学 1のスケジュール 4 月 20 日 講義開始 6 月 1 日 中間試験 9 月 25 日 生化学 1 試験 講義日程 内容は一部変更があります 講義資料 ( 山縣 吉澤分 ): 熊本大学病態生化学 で検索 ID: Biochem2 パスワード :76TgFD3Xc 生化学 1 の合否判定は
13FG-生物-問題_H1.indd
平成 25 年度次世代の科学技術を担う人材育成事業 福岡県 高校生科学技術コンテスト 総合問題 生物 注意事項 1 試験開始の合図があるまで, この問題冊子の中を見てはいけません 2 試験中に問題冊子の印刷不鮮明, ページの落丁 乱丁及び解答用紙の汚れなどに気付いた場合は, 挙手をして監督者に知らせなさい ただし, 問題内容にかかわる質問は, 受け付けません 3 解答用紙には, 解答欄以外に次の記入欄があるので,
yakugaku-kot.ppt
2009 Masaaki Kotera kot@kuicr.kyoto-u.ac.jp 2 I II / A () B1 () B2 B12 C () D A D () () () () DNA 5- http://www.genome.jp/kegg/pathway.html KEGG PATHWAY Database Xenobiotics biodegradation http://www.genome.jp/kegg/pathway.html
会報35号表紙.pdf
35 No. (2017 1 ) RNA 2017 2017 TV 365 365 chunky 26 RNA 2017 Congratulations26 30-1 - RNA 2017-2 - - 3 - - 4 - - 5 - - 6 - 2016 8 31 9 2 RNA 2016 1 RNA RNA RNA RNA RNA 1-7 - RNA RNA 3 3 7 31 RNA ncrna
スライド 1
生化学への導入 平成 30 年 4 月 12 日 病態生化学分野教授 ( 生化学 2) 山縣和也 生化学とは 細胞の化学的構成成分 およびそれらが示す化学反応と代謝機序を取り扱う学問 ハーパー生化学 生化学 1 生化学 2 生化学 炭水化物 / 糖 脂質 アミノ酸について勉強します 糖 脂質生化学 2 脂質 アミノ酸 核酸 生化学 1 生化学と医学は密接に関係する 炭水化物 脂質 生化学 蛋白質 核酸
™·”õ/sec3_p63_84/fiü“eflÅ
Section3 64 1 65 Section 3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 1 Babara E. Ainsworth et al. Med. Sci. Sports. Exevc.1993 66 67 Section 3 1 10 9 8 1 2 3 4 7 6 5 6 7 5 1 2 3 4 68 69 Section 3 2 70 Section 3
狂牛病調査第２巻1章，２章.doc
21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 2.1 A LD50/30mg () 10 ND 1 2.8 ND ND ND 11 ND 2.3 1.0 ND ND 11 ND ND 1.3 1.7 ND 13 ND
Microsoft PowerPoint - molsim-okamoto-07I
第 11 回分子シミュレーション夏の学校 August 1-3, 2007 拡張アンサンブル法と 生体分子シミュレーション Yuko OKAMOTO( 岡本祐幸 ) 名古屋大学 大学院理学研究科 物理学教室 e-mail: okamoto{a}phys.nagoya-u.ac.jp URL: http://jegog.phys.nagoya-u.ac.jp/tb/ Contents (I) Protein
(1) GGT阻害剤
(GGT) (glutathione, GSH, -L-Glu-L-Cys-Gly) Cys 1 10 mm GSSG GSH 98% - + H 3 N COO - γ- O H N O N H SH O γ-glu Cys Gly OH - (GGT, EC 2.3.2.2) GGT (GSH) GSX - Glu Cys(X)-Gly 1-2) GGT - 1 hydrolases transferases
本文／Ａ６１４３Ｉ
trna CUG RNA trna mrna trna trna trna trna trna RNA RNA trna UGA UGA UAA UAA UAG Stop Trp Stop Cys Stop Glu Stop Gln Mycoplasma spp. Spiroplasma citri Bacillus subtilis Hodgkinia cicadicola Colpoda inflata
ナノの技術をバイオに応用
本日まで お試し期間 なので 出席は取りません 現代生物学概論 2 遺伝子 ( プログラム ) と蛋白質 ( ナノマシン ) 先進理工学科 化学生物学研究室 准教授 生体機能システムコース 瀧真清 1 本日の概要 : 蛋白質生合成の全スキーム D から蛋白質への情報の流れ アミノ酸から蛋白質への物質の流れ 転写 D 本日は詳細は省略 アミノアシル tr 合成酵素 (RS) 翻訳 mr コドンーアンチコドンの対合
PowerPoint プレゼンテーション
2016 年 10 月 19 日 ( 水 ) バイオ情報解析演習 ウェブツールを活用した生物情報解析 (1) 配列と代謝経路の解析の基礎 有用物質生産菌を合理的に作ろう! 設計 試作 ベンチテスト 完成 プラスミド 効率的な代謝経路を設計する 文献調査代謝パスウェイの探索代謝シミュレーション 実際に微生物に組み込む データベースから有用遺伝子を探索する遺伝子組換え技術 培養をして問題点を突き止める
日本化学療法学会雑誌第57巻第1号
In vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli in vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli µs. pneumoniae E. coli µ Key words in vitrostreptococcus pneumoniae Escherichia coli Escherichia coli
島津ジーエルシー総合カタログ2017【固相抽出】
アミノ酸分析キット 固https://solutions.shimadzu.co.jp/glc 241 EZ:faast ( イージーファースト ) LC/MS LC/MS/MS GC/FID GC/MS 分析可能な 60 種以上の脂肪族 芳香族アミノ酸 Chemical Name Abbreviation LOD (nmol/ml) S/N 3:1 FID MS Alanine ALA 1 0.1
syoku10_10.indd
690 64 10 2010 I Pythium Pythium Pythium 1 2 Qualitative and Quantitative Detection of Plant Pathogens. Pythium By Koji KAGEYAMA PCR Pythium Pythium 2006 II PCR PCRPolymerase Chain ReactionDNA PCR 2005PCR
DA RA
II 3ADT2206 19 3 1 1 1 5 2 5 2.1 DA................................................ 5 2.2 RA................................................ 7 2.3.......................................... 8 2.4....................................
2 研 究 背 景 食 肉 は 量 的 生 産 を 目 的 とした 時 代 から 質 的 生 産 に 切 り 替 わった しかし 食 肉 品 質 には 多 数 の 要 素 が 関 係 し(タンパク 質 脂 肪 糖 熟 成 など) 食 品 の 中 でも 評 価 が 難 しいとされる そこで 諸 々の
1 アミノ 酸 関 連 物 質 による 食 肉 の 美 味 しさ 制 御 技 術 新 潟 大 学 農 学 部 応 用 生 物 化 学 科 准 教 授 藤 村 忍 2 研 究 背 景 食 肉 は 量 的 生 産 を 目 的 とした 時 代 から 質 的 生 産 に 切 り 替 わった しかし 食 肉 品 質 には 多 数 の 要 素 が 関 係 し(タンパク 質 脂 肪 糖 熟 成 など) 食 品 の
表1.eps
Vol.1 C ontents 1 2 cell-free EMBO J Proc. Natl. Acad. Sci. USA NatureEMBO J 3 RNA NatureEMBO J Nature EMBO J 4 5 HCV HCV HCV HCV RNA HCV in situ 6 7 8 Nat Struct Mol Biol J Biol Chem Nat Commun J Virol
2
1 2 / SCAR Sequence characterized amplified region DNA DNA 34 ( GSW100 SP2-002 SR2-015 SR3-004 11-22-1 11-22-2 11-24-3 11-24-4 11-191-1 12-217-1 12-249-1 14-218-21 04/05-29 04/05-66 04/05-73 12-202-2 (LP)
Res. Org. Geochem. 31, 1 17 (2015) 地球 環境有機分子質量分析マニュアル No.29 技術論文 LC/ESI-MS * ** ** ** はじめに Eksborg and Schill, 1973; Gloor and
Res. rg. Geochem. 31, 1 17 (2015) 地球 環境有機分子質量分析マニュアル No.29 技術論文 LC/ESI-MS * ** ** ** 2014 9 16 2014 12 1 1. はじめに Eksborg and Schill, 1973; Gloor and Johnson, 1977; Chaimbault et al., 2000 Knox and Hartwick,
光合成におけるエネルギー生産について
CO 2 CO 2 RuBisCO phytochromobilin Pr Pfr CO 2 1 CO2 a b b CHO a a - H+ H+ e - e - Mn Yz e - Q B P680 Q A Mn Yz P680 Q A Q B e ē - e - Mn Yz P680 Q A Q B Mn e - Yz P680 e - Q A Q B H 2 O Mn Yz e - P680
<4D F736F F F696E74202D2091E682508FCD E836D8E5F82C6835E E8EBF205B8CDD8AB B83685D>
生物有機化学 教科書 : マクマリー 生物有機化学生化学編 rganic and biological chemistrybiochemistry 生物 ( 生命 ) をより深く理解する 分子レベルで = 有機化学的に 地球の凄さ水 + 空気の世界 ( 2, 2 ) 水 : 酵素反応の溶媒 ( 反応の場を提供 ) ものを溶かす ( 物質によって溶解性は違う ) Why? 水 : 酵素反応の溶媒 (
色覚（初組4）.pm
733 3 1 520 1 8 4 0.2500 1 30012 1 AB 3 22 3 1 2 http://www.nig.ac.jp/labs/devgen/mou.html 734 1.1 360nm 830nm 380nm 780nm 540nm 580nm 660nm 540nm 660nm Log relative corneal sensitivity 0 1 2 400 500 600
終 止 コ ド ン か ら ア ミ ノ 酸 指 定 コ ド ンへ の 変 化 は,す べ 対 応 す る こ と を 見 い だ し た14).さ で 説 明 で き る で あ ろ う.ま に か か わ るtRNAGlyUCU遺 伝 子 を 検 出 し,こ Glyコ 翻 訳 に か か わ るtRNAGlyUCC遺 の 変 化 は,こ た,AUAのIleか の 暗 号 を解 読 す るtRNAの
37-4.indd
ISSN 0916-3328 東京大学アイソトープ総合センター VOL. 37 NO. 4 2007. 3. 26 アイソトープ総合センターの将来展望 40 18 18 20 3 800 1/3 1300 14 18 20 3 19 2 生きた細胞内の分子過程を 時間 空間計測する蛍光プローブの開発 1. はじめに Fura-2 Fura-2 198 1, 2 3, 4 2. 生体脂質分子の機能とその分析
本文／ＹＡ４２７８Ｉ
pp. D- D-DAO DAO D- D- D- D- o- DAO-D- D-DAO DAO Hans Krebs FAD X DAO DAO DAO D- Structure and reaction mechanism of D-amino acid oxidase Yasuzo Nishina School of Health Sciences, Kumamoto University,
v 1 v 2 e g ˆ Š Œ Ž p š ~ m n u { i 1, i 2, i 3, i 4 } { i 1, i 5 } v 1 v 2 v 3 v 4 v 5 v 6 { i 1, i 2, i 4 } { i 1, i 2, i 3, i 5 } { i 1, i 3, i 4 }
DEIM Forum 2009 D2-1 COPINE: 112 86 2 1 1 E-mail: {seki,sesejun}@sel.is.ocha.ac.jp COPINE COPINE: Mining Networks Sharing Common Patterns Mio SEKI and Jun SESE Graduate School of Humanities and Sciences,
HOE901 A S S Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Gly
HOE901 A S S Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Gly 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 S S S Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly Ser His Leu
< > Introduction to Basic Physical Chemistry 1,2 2 [ advanced [ [ [ [ [ KULASIS
< > Introduction to Basic Organic Chemistry 1,2 [ 2 [ 10 11 12 13 14 15 [ [ [ [ KULASIS < > Introduction to Basic Physical Chemistry 1,2 2 [ advanced [ 11 12 14 15 [ [ [ [ KULASIS < > Introduction to Basic
Microsoft PowerPoint - ã…’ã‡¤ã…ƒã‡¯ã†®ä¸ŒçŁ„2018
1. 核酸と遺伝子 核酸とは ヌクレオチドの重合体で構成される生体高分子 例として ( デオキシリボ核酸 ) や RNA( リボ核酸 ) がある 核酸は遺伝情報物質であり いわば生命の 設計図 である 1 遺伝情報と 遺伝情報 : 生物が個体として生命活動を営むのに必要なすべての情報遺伝情報は ヒトの場合染色体 ( ゲノム ) に格納されている 子のゲノムは 両方の親からそれぞれ受け継いだ 2 組のゲノムを持つ
ŁRŁ¸•ñŁŁŁ‘
16 11 5 25mg 14 11 18 1 25mg 1 150,000 934 1 2 : 1-235-tumor necrosis factor receptor (human) fusion protein with 236-467-immunoglobulin G1 (human γ1-chain Fc fragment), dimmer : : 1 235 236 467 G 1 γ1
< > Introduction to Basic Physical Chemistry 1,2 2 [ advanced [ [ [ [ [ KULASIS
< > Introduction to Basic Organic Chemistry 1,2 [ 2 [ 10 11 12 13 14 15 [ [ [ [ KULASIS < > Introduction to Basic Physical Chemistry 1,2 2 [ advanced [ 11 12 14 15 [ [ [ [ KULASIS < > Introduction to Basic
,328 C 6426 H 9900 N 1700 O 2008 S , ,
2458 13 4 24 1 11 9 17 1,328 C 6426 H 9900 N 1700 O 2008 S 44 145,000 148,000 10 11 27 2 13 4 24 11 9 17 (1) CD20 B CD20 (2) infusion reaction infusion-associated symptom CD20 B 1 375mg/m 2 1 4 3 Heavy
計算機生命科学の基礎II_
Ⅱ 1.4 atsushi_doi@cell-innovator.com 812-8582 3-1-1 8 806 http://www.cell-innovator.com BioGPS Connectivity Map The Cancer Genome Atlas (TCGA); cbioportal GO DAVID, GSEA WCGNA BioGPS http://biogps.org/
問 1. 次の文章を読み 以下の設問 (1)~(3) に答えよ タンパク質 X の N 末端にヒスチジンタグを付加し これを大腸菌で大量発現して精製する実験を計画している (1) その準備として 遺伝子 x を PCR で増幅し T7 プロモーターを持つベクター (pet28a) の NdeI と
2016 年 7 月 17 日実施 2017 年度 ( 夏季 ) 理学研究科博士課程前期課程生命理学専攻入学試験問題 ( 生命理学 ) [ 注意 ] 合図があるまでこのページをめくらないこと すべての解答用紙に受験番号を記入すること 解答はすべて解答用紙に記入し 問題 1 問につき解答用紙 1 枚を使用すること 解答用紙の裏面を使用してもよいが その場合には裏面にも解答が記入されていることを 表面の下部に
DiovNT
Custom Services Custom Services 332 Custom Services 331 ペプチド合成依頼書 ( 見積依頼書 発注 ) 年月日 ご依頼者 ご住所 - 勤務先 ご所属 フリガナ お名前 T E L - - ( 内線 ) F A X - - E-mail アミノ酸配列 ( アミノ酸配列は1 文字表記 3 文字表記どちらでも結構です ) N 末端 C 末端 1 2 3
I 2 ESI - Ion Trap
I 2 ESI - Ion Trap 2011 35 ESI 520l/min 35V V Taylor 20 R N- ESI) Intens. x10 8 1.0 14+ 15+ 883.9 825.1 Cytochrome c 12000 Da 09123cyto mass00003.d: +MS 0.8 0.6 0.4 0.2 0.0 17+ 728.1 16+ 773.6 13+ 951.8
15K00827 研究成果報告書
(TG) TG sterol regulatory element- binding protein (SREBP)-1c (Diabetes 53:560-569, 2004) SREBP-1c (1) SREBP-1c SREBP-1c liver X receptor (LXR)LXR O-Glc NAc (O-linked -N-acetyl glucosamine) (J Biol Chem
MB-lecture12.pptx
タンパク質の発現精製方法 目的遺伝子 タンパク質発現に用いる生物種のプロモーター例 )Lac (E. coli) ADH1 (S. cerevisiae) Promoter STOP タンパク発現用プラスミド マーカー遺伝子 ( 薬事耐性など ) 複製開始点 198 培地中のラクトース E. coli lac promoter E. coli でのタンパク質発現の例 pet system T7 RNA
PowerPoint プレゼンテーション
2013 年 10 月 30 日 ( 水 ) バイオ情報解析演習 ウェブツールを活用した生物情報解析 (1) 配列と代謝経路の解析の基礎 有用物質生産菌を合理的に作ろう! 設計 試作 ベンチテスト 完成 プラスミド 効率的な代謝経路を設計する 文献調査代謝パスウェイの探索代謝シミュレーション 実際に微生物に組み込む データベースから有用遺伝子を探索する遺伝子組換え技術 培養をして問題点を突き止める
第43回生化学若い研究者の会夏の学校資料
43 pdf 030720 8 8 15 10-18 00 WS1. Bio MBL 8 8 15 10-18 00 WS2. 80 1996 E-CELL (Tomita 1999) E-CELL E-CELL E-CELL (metabolome) 13 ``E-CELL: Software environment for whole cell simulation'' Tomita, M.,
A b a B AaBb Ab ab 1 1 AB ab A-b a-b 2.Meiosis recombination Meiosis mitosis crossover recombination bivalent DNA 2
遺 伝 と 遺 伝 子 2007 年 度 参 考 問 題 リストの 解 答 例 xxax2002@yahoo.co.jp 2007 50 50 1. Mendel s second law of inheritance 2006 2006 A B A B Mendel s second law of inheritance principle of independent segregation P
Nov12_2009.pptx
h"p://www.ebi.ac.uk/tools/emboss/align/index.html UNIPROT TPIS_HUMAN, TPIS_RABIT FASTA Run #########################################! Program: needle# Rundate: Tue Nov 10 02:40:01 2009! #########################################!
Infinium BeadChip COGS BeadChip 4 * iselect 3 SNP 25 1 SNP NGS Sequencing by Synthesis SBS HiSeq MiSeq WGS 1 RNA-Seq ChIP-Seq 1 1 * icogs BCAC OCAC PR
Infinium BeadChip COGS BeadChip 4 * iselect 3 SNP 25 1 SNP NGS Sequencing by SynthesisSBSHiSeq MiSeq WGS 1 RNA-Seq ChIP-Seq 1 1 * icogs BCACOCAC PRACTICALBRCA1/2 CIMBA www.illuminakk.co.jp DNA CE DNA DNA
タンパク質を物性科学的に見た場合、単なるアミド結合の集合体であると片づけるにはもったいなさすぎる
Precise Functional Analysis of Biological Macromolecules Promoted by the Encounter of Crystallographic and Spectroscopic Molecular Structure Analyses Takamitsu Kohzuma*, Sachiko Yanagisawa, and Tomotake
目次 CONTENTS PRESS RELEASE GALLERY ~3 細胞機能を 在に制御 改変する技術 Nano-heater による細胞熱 学エンジニアリング Technology to Manipulate Cellular Functions Using a Nano-hea
WASEDA Technology Licensing Organization TECHNOLOGY OFFERS 1 細胞機能を自在に制御 改変する技術 ~ Nano-heaterによる細胞熱力学エンジニアリング ~ Technology to Manipulate Cellular Functions Using a Nano-heater: Cellular Thermodynamics Engineering
ẋ = ax + y ẏ = x x by 2 Griffith a b Saddle Node Saddle-Node (phase plane) Griffith mrna(y) Protein(x) (nullcline) 0 (nullcline) (
2 (bifurcation) Saddle-Node Hopf Pitchfork 2.1 Saddle-Node( ) 2.1.1 Griffith : (bistability) ON/OFF 2 (bistability) (Stable node Stable spiral) 2 Griffith X mrna mrna X Griffith ( x y mrna ) 2.1: Griffith
PowerPoint プレゼンテーション
衛生微生物技術協議会第 39 回研究会 滋賀県大津市 2018 年 7 月 5 日 ( 木 ) 国立感染症研究所ウイルス第 1 部 イム チャンガン 世話人 林 昌宏 アルボウイルスレファレンスセンター 担当ブロック 機関 担当部 課 世話人 国立感染症研究所 ウイルス第 1 部第 2 室林昌宏 北海道 東北ブロック 宮城県保健環境センター 微生物部 関東 甲信越ブロック 東京都健康安全研究センター
分子系統樹作成方法
実 習 1: MEGA6 のダウンロードとインストール MEGA の Web サイトは http://www.megasoftware.net/( 下 図 ) 正 式 には 左 側 の[Windows]ボタンをクリックし 名 前 とメールアドレスを 入 力 して[Submit Request]をクリックすると ダウンロード 用 のアドレスがメールで 送 られる 実 習 2: 配 列 データのダウンロードとアライメント
(Quality of Life; QL) QL (Nerve Growth Factor; NGF) NGF PC12 6- (6-HITC) NGF NGF NGF PTP1B 6-HITC PTP1B NGF PTP1B 6-HITC PTP1B 6-HITC NGF 6-HITC 6-HITC in vivo 464-8601 Tel: 052-789-4126 20-Hydroxyecdysone
(nod/nol/noe) Nod 1B Nod 1B Nod Nod 2) Nod Nod Ca 2+ 3,4) 7,000 5) Myc Nem nod, exo nif, fix 2000 Mesorhizobium loti 2002 Bradyrhizobium japonicum DNA
63 110 1) 1A 1980 1BC (nod/nol/noe) Nod 1B Nod 1B Nod Nod 2) Nod Nod Ca 2+ 3,4) 7,000 5) Myc Nem nod, exo nif, fix 2000 Mesorhizobium loti 2002 Bradyrhizobium japonicum DNA 6, 7) (Symbiosis island) t-rna
Various function and toxicity of iron Key words 1) Hentze, M. W. et al: Cell, 117, 285-297 (2004) 2) Ganz, T.: Blood, 102, 783-788 (2003) 3) Nemeth, E. et al.: Science, 306, 2090-2093 (2004) 4) Hentze,
日本化学療法学会雑誌第66巻第2号
173 Table 1.Detection rates of Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Haemophilus influenzae and adenovirus from male urethritis in Urethritis No.
会報36号表紙
36 No. ( 2017 9 ) RNA 2017 RNA 19 7 19 21 7 8 JR RNA RNA 20 RNA RNA RNA RNA 10 50 13 26% 40 RNA RNA-SEQRNAiCRISPRCLIP RNA RNA - 1 - 3 29 8-2 - ips - 3 - - 4 - - 5 - RNA 29 RNA RNA 5 microrna trna? RNA
(12・6No.3)予稿集資料（福岡大学 福田）-1
1 R 編集機構を利用した 部位特異的 R 変異導入を可能にする 新規ガイド R 福岡大学理学部化学科 助教福田将虎 2 研究背景 ( タンパク質の合成経路 - セントラルドグマ -) D 設計図 R D 情報を運ぶ タンパク質 生命現象の担い手 遺伝情報は D R タンパク質の順に流れる タンパク質の様々な機能により生命現象が支えられている 3 研究背景 ( タンパク質機能の異常は病気の原因 )
Database Center for Life Science Online Service Vol.48 No.16 (2003)
Database Center for Life Science Online Service Key words Kikuya Kato, E-mail : kkato@bs.aist-nara. ac.jp http://love2.aist-nara.ac.jp Shin Ishii, E-mail : ishii@is.aist-nara.ac.jp http://hawaii.aist-nara.
第124回日本医学会シンポジウム
III γ γ γ α γ Molecular Mechanism of Insulin Resistance by Adipocytes TAKASHI KADOWAKI Department of Metabolic Diseases, Graduate School of Medicine, University of Tokyo Key words γ 110 124 TNFα FFA 1,2
PowerPoint プレゼンテーション
アミノ酸代謝 (1) 平成 30 年度 6 月 14 日 1 限病態生化学分野 吉澤達也 アミノ酸代謝 アミノ酸の修飾 食物タンパク質 消化吸収 分解 タンパク質 (20 種類 +α) 遊離アミノ酸 生合成 アミノ酸の生合成 ( 栄養学的非必須アミノ酸 ) 窒素 分解 炭素骨格 非タンパク質性誘導体 ( 神経伝達物質 ホルモン アミノ糖など ) 尿素サイクル 代謝中間体 尿素 糖質 脂質 エネルギー
B0B820DFD845F9DE49256B7D0002B34
平成 13 年 ( 行ケ ) 第 238 号特許取消決定取消請求事件 ( 平成 13 年 11 月 2 9 日口頭弁論終結 ) 判決原告バイオ-ラッドラボラトリーズ インコーポレイティド ( 旧表示ジェネティックシステムズコーポレイション ) 訴訟代理人弁護士上谷清同宇井正一同笹本摂同弁理士福本積被告特許庁長官及川耕造指定代理人後藤千恵子同森田ひとみ同茂木静代主文特許庁が平成 10 年異議第 73683
.J.[.v/01..
1 J.L. Tan, et al., Proc. Nat l. Acad. Sci. U.S.A. 100, 42003Christopher S. Chen, The Johns Hopkins University 11 12 13 2 14 Box 11 Box 12 11 4 1 14 15 7 6 50 Å 2 0.2 µm 5 25 nm 3 1 4 35Å 10 µm 0.5 µm
1 Nippon Shokuhin Kagaku Kogaku Kaishi Vol. /., No.1, (,**1) 313 * ** * ** Regional Chemical Composition and Microbial Flora of Commercial Hat
1 Nippon Shokuhin Kgku Kogku Kishi Vol. /., No.1, -+--+3 (,**1) 313 * ** * ** Regionl Chemicl Composition nd Microbil Flor of Commercil Hthtzushi from Akit Prefecture Kenichi Tsukmoto, Kzuki Toed, Tsutomu
Tox
Gel Shift Assay Systems No. TB110J 2000 9 E3050 E3300 I. 2 II. 2 III. A. 3 B. 3 IV. A. 4 B. 4 V. A. 5 B. HeLa Nuclear Extract DNA 6 C. AP2 Extract DNA 7 D. DNA- 7 VI. VII. VIII. IX. 8 8 9 13 X. A. 14 B.
Microsoft PowerPoint _生物配列解析基礎_3回目.pptx
1 古細菌 真正細菌 3 4 多くの生物にはDNA修復を行う機 構が備わっており これらをDNA 突然変異 修復系と呼ぶ アルビノのカラス １つのDNAに生じた突然変異によって鎌状赤血球貧血症になる 5 進化の総合説 現在 進化を説明する理論 として最も支持されている のは進化の総合説と呼ばれ るもので 自然選択説や突 然変異説 隔離説 メンデ ルの遺伝子の理論 集団遺 伝学の理論や中立進化説な どを統合したものである
研究成果報告書
20 6 UAA UGA UAG 20 Pyl. Pyl (AlocLys) N(epsilon)-benzyloxycarbonyl-lysine (ZLys) N(epsilon)-(o-azidobenzyloxycarbonyl) -lysine oazzlys (Yanagisawa et al., 2008b) N(epsilon)-(p-trifluoromethyldiazirinylbenzyloxy
遺伝子ネットワーク解析
1.3 atsushi_doi@cell-innovator.com 6-10-1 I 2 http://www.cell-innovator.com 1 2 23andMe, GeneQuest, MYCODE DNA RNA DNA RNA DNA A, T, G, C RNA or = BioCyc (EcoCyc) KEGG Reactome WikiPathways TRANSPATH
能書単頁9[1].5(2)
![能書単頁9[1].5(2)](/thumbs/87/96620151.jpg "能書単頁9[1].5(2)")
ips CytoTune -ips ver.1.0 1 I CytoTune ips 3 II 3 3 4 5 III CytoTune ips ips 6 6 6 6 7 1) 2) ips 8 ips 8 SeV 9 SeV 10 IV Q&A 11 V 12 12 VI...13 13...13 2 I CytoTune ips CytoTune ips 4 OCT3/4SOX2 KLF4c
3. 生化学的検査 >> 3C. 低分子窒素化合物 >> 3C045. 検体採取 患者の検査前準備 検体採取のタイミング 記号添加物 ( キャップ色等 ) 採取材料採取量測定材料ネ丸底プレイン ( 白 ) 尿 9 ml 注 外 N60 セイカ 検体ラベル ( 単項目オーダー時 ) ホンハ
3. 生化学的検査 >> 3C. 低分子窒素化合物 >> 3C045. amino acid fractionation 基本情報 3C045 分析物 連絡先 : 3764 JLAC10 診療報酬 識別 材料 001 尿 ( 含むその他 ) 測定法 204 高速液体クラマトグラフィー (HPLC) 結果識別 第 2 章 特掲診療料 D010 5 アミノ酸 第 3 部 検査 D010 5ロ 5 種類以上
4) H. Takayama et al.: J. Med. Chem., 45, 1949 (2002). 5) H. Takayama et al.: J. Am. Chem. Soc., 112, 8635 (2000). 6) H. Takayama et al.: Tetrahedron Lett., 42, 2995 (2001). 9) M. Kitajima et al: Chem.
Polyoxometalateが有するcysteine検出能の検討及びジスルフィド結合形成反応への展開
チオールを特異的に酸化し 発色する 山形大学理工学研究科バイオ化学工学専攻准教授今野博行 金属酸化物クラスターアニオン ポリオキソメタレート Polyoxometalate (POM) 金属元素に酸素が6個配位した MO6を基本骨格とする金属酸化物 1 nm クラスターアニオン MO6 (octahedron) ( PxMyOz )n 構造 構成元素 対カチオン等を 制御することで 様々な機能性を
7-1（DNA配列から遺伝子を探す）.ppt
DNA 配列の中から遺伝子を探す Blast 解析.6 Query DNA 塩基配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 データベース DNA 塩基配列アミノ酸配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 1. 2. 3. TATGGCTTA---- T G L TATGGCTTA----
研究成果報告書
(P Pleurodeles Dev (ck waltl) v. Growth Di CRE-l KO) cko ffer., 2013 loxp DNA TALEN D cko TA loxp Dev. Growth ck O CR TALEN Differ., 2014 cko KO (cko) CDK1 cko RE 4 O 10 ) cko 1 cko O loxp TALEN CRISPR
<4D6963726F736F667420506F776572506F696E74202D203134303333305F945F8C7C89BB8A7789EF83568393837C8357834583808169938C91E5814589699363816A8CF68A4A97702E707074205B8CDD8AB78382815B83685D>
構 造 生 物 学 とバイオインフォマティクスの 境 界 領 域 における 研 究 支 援 と 高 度 化 創 薬 等 PF 情 報 拠 点 東 大 院 農 生 科 永 田 宏 次 情 報 拠 点 分 担 課 題 : 構 造 生 物 学 的 立 場 からのデータベース 運 用 支 援 と 高 度 化 情 報 領 域 東 京 大 学 ( 永 田 宏 次 ) 課 題 概 要 全 国 の 生 命 科 学
本文／ＹＡ４０９６Ｅ
Montiel, M.D., Krzewinski-Recchi, M.A., Delannoy, P., & Harduin-Lepers, A.Biochem. J.,,. Nagata, Y., Yamashiro, S., Yodoi, J., Lloyd, K.O., Shiku, H., & Furukawa, K.J. Biol. Chem.,,. Dohi, T., Nishikawa,
たんぱく3000web.indd
1 2 4 5 3000 6 8 3000 10 10 11 11 12 12 13 13 14 18 19 20 21 Atg 22 23 24 21 X 143000 3000 19 3000 20 25 X 26 27 28 1 20 DNA mrna DNA RNA mrna 3000 DNAmRNARNA SPring-8X Artsimovitch, I. et al., Cell 117,
ウイルス進化_池村
インフルエンザA 型ウイルス株のゲノムは8 本のセグメントから構成されているが 8 本の全セグメントの配列が解読されている株のみに着目 全インフルエンザ A ウイルス 5350 株を対象とした に基づいた BLSOM 解析 : Avian, 1948 株 : Human, 2955 株 : 新型 : Equine, 68 株 : Swine, 249 株 : Other(Seal, Tiger etc),
食糧 その科学と技術 No.45(2007.03)
PCR γ Bacillus subtilis natto Bacillus subtilis Bacillus subtilis Bacillus subtilis 168 γ Insertion sequence γ L D α γ Bacillus Bacillus subtilis Bacillus licheniformis Bacillus anthracis Bacillus megaterium
(2) (2) (3) (3) (4) ABI PRISM 7700 TaqMan (4) Roche LightCycler TM (5) BioFlux LineGene TaqMan (6) 1 RT-PCR (7) (9) (10) F. Hoffmann-La Roche Ltd. Roc
05-8 Realtime PCR Master Mix (Code No. QPK-101, QPK-101T) TOYOBO CO., LTD. Life Science Department OSAKA JAPAN A3313K (2) (2) (3) (3) (4) ABI PRISM 7700 TaqMan (4) Roche LightCycler TM (5) BioFlux LineGene
本文／ＹＡＹ１１６Ｋ
pp. GH GH GH β- - D- β- β- β- - EC J Alkalitolerant mechanism and improvement of alkalitolerancy of glycoside hydrolases Satoshi Nakamura Department of Bioengineering, Tokyo Institute of Technology, J
本文／ＹＡ３１８０Ｃ
pp. D- Frontier Science in Amino Acid and Protein Research L L D D-D-Asp Asp D Asp D L D L D L D L D L D L-D- Racemization of aspartyl residues of proteins in age-related disease Noriko FujiiResearch Reactor
本文／ＹＡ６２８０Ｃ
H., Hoshino, K., Kaisho, T., Kuwata, H., Takeushi, O., Takeshige,K.,Saitoh,T.,Yamaoka,S.,Yamamoto,N.,Yamamoto, S., Muta, T., Takeda, K., & Akira, S.Nature,,. Yamazaki, S., Muta, T., Matsuo, S., & Takeshige,
PDBj : : 1
PDB (PDBj) http://www.pdbj.org Mar. 3, 2008 PDBj : : 1 PDBj PDB ID / / XML (xpsss) (Sequence-Navigator) (Structure-Navigator) (ASH) (ProMode) (ef-site) (EM-Navigator) New! GUI (Protein Globe) New! (eprots)
…Q…m…•ŒÊŁt‡¯
Genome Sequence ACEDB (genomic database system) Ace.mbly (graphic interactive program to support shotgun and directed sequencing projects) ARTEMIS II (non-clinical product safety assessment) Bass (lane
Agilent Microarray Total Solution 5 5 RNA-Seq 60 mer DNA in situ DNA 5 2 QC 4200 TapeStation 2100 / mirna CGHCGH+SNP ChIP-on-chip 2 mirna QC
Microarray Agilent Microarray Total Solution Agilent Microarray Total Solution 5 5 RNA-Seq 60 mer DNA in situ DNA 5 2 QC 4200 TapeStation 2100 / mirna CGHCGH+SNP ChIP-on-chip 2 mirna QC RNA / mirna total
<95AA8E718CA4838C835E815B D862E696E6464>
T1r T1r1 T1r3 T1r2 T1r3 [1] T1r T1r 500 LBD 1 LBD T1rLBD [2] T1r T1r2a T1r3 LBD [3] T1r2a/T1r3 L- [4] T1r2a/T1r3LBD M~ M T1rLBD FRET FRET T1rLBD [3] 1 T1r 2 T1r2a/T1r3 X [3] 28 75 March 2017 T1rLBD imsaxst1r2a/t1r3lbd
untitled
ORYZA POLYAMINE ORYZA POLYAMINE -P -PC -LC 1. Ver.1.0 MM ver. 1.0MM 1) Roseeuw D.I. et al., Epidermal keratinocytes actively maintain their intracellular polyamine levels. Cell Tissue Kinet. 16, 493-504
Microsoft PowerPoint 説明資料（きのこを活用してGABA富化素材を作る）林産試験場
きのこを活用して GABA 富化素材を作る 説明内容 はじめに きのこと GABA のこと 本技術の開発と技術内容 GABA に着目した理由 きのこのGABA 生産能素材の機能性評価素材生産プロセスの効率化 本技術の活用 素材の多様化 用途企業等への期待 課題 展開 施設栽培により生産されているきのこ GABA( ギャバ ) の機能性 血圧上昇抑制精神安定成長ホルモン分泌促進その他記憶学習促進体重低減血中の中性脂肪低減
090825_Sakate_for_dist.pptx
21 子 比 Evola 用 http://www.h-invitational.jp/evola/ 手龍一 2009 8 月 25 日 火 心 H-InvDBEvola 子 子 子 子 子 日 比 Evola 用 比 子 Evola 方 比 子 Evola 子 H-InvDB 6 子 比 子 生 子 生 生 片 方 比 長 大 子 生 長 生 22,496 子 13 生 長 魚 比 http://www.h-invitational.jp/g-compass/
25 6 7 X (crystallizing ligand) Fv Fv 3.5 Co-crystallization of membrane proteins with antibody fragments may emerge as a general tool to facilitate crystal growth and improve crystal quality. The bound
本文３／ＹＡ８１８３Ｅ
pp. N Tom Tom Tom - Tom µm Soft interaction for the recognition of mitochondrial targeting signal Daisuke Kohda Division of Structural Biology, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Maidashi,
バイオ医薬品における特許の現状
18 1 1 2 2 7 1970 3 DNA 4 5 A REMICADE TM 6 6-506120 New York University, Centocor, Inc. 1 1 TNF a A2 TNF b TNF HERCEPTIN TM HUMIRA TM Genentech G HERCEPTIN trastuzumab 1998 FDA HER2 HER2 7 HERCEPTIN HERCEPTIN
本文／ＹＡ３１８０Ｄ
pp. D- Frontier Science in Amino Acid and Protein Research D- D- N - D- D- D-DAP, EC D-DaaA Ser β- D D- Discovery of D-stereoselective amino acid amidases, and their use in kinetic resolution of amino